Vztah mezi strukturou a funkcí elicitinů

Mgr. Michal Obořil, Ph.D.

Doctoral thesis

Relation between the elicitins structure and their function

Abstract:

Rostliny jsou neustále vystaveny biotickému či abiotickému stresu. Významným patogenem dvouděložných rostlin jsou patogenní oomycety rodu Phytophthora. Tyto oomycety způsobují celosvětově značné škody na hospodářsky významných plodinách. Jelikož druhy rodu Phytophthora nejsou schopny syntetizovat některé typy sterolů, sekretují malé bazické proteiny, které jsou schopné přenášet steroly mezi biologickými membránami. Tyto proteiny se nazývají elicitiny. Elicitin sekretovaný druhem Phytophthora cryptogea se nazývá cryptogein a již ve velmi nízkých koncentracích způsobuje hypersenzitivní reakci na rostlinách tabáku (Nicotiana tabacum). Elicitiny jsou obecně charakterizovány jako MAMPs, jsou tedy rozpoznávány PRRs receptory nacházejícími se na plasmatické membráně hostitele. Tato práce se zabývá vztahem mezi strukturou a biologickou aktivitou elicitinů. Pro účely tohoto výzkumu byl použit modelový systém cryptogein – Nicotiana tabacum.

Abstract:

During their life time, plants are exposed to constant biotic or abiotic stress from environment. Pathogenic oomycetes of genus Phytophthora are considered to be most devastating pathogens of dicotyledonous plants. Losses on economically important crops inflicted by Phytophthora species are enormous. As Phytophthora species relies on sterols from host plants, they secrete small basic proteins, which exhibit sterol transfer activity, these proteins are called elicitins. Even in low concentrations, elicitin cryptogein, secreted by Phytophthora cryptogea triggers hypersensitive reaction of Tobacco plants (Nicotiana tabacum). Elicitins are generally classified as MAMPs and are thus recognized by pattern recognition receptors (PRRs) of host plasma membrane. Presented work investigates relation between elicitin structure and its activity on host plant. For purposes of this research, we used model system of cryptogein and Nicotiana tabacum plants.

Keywords

Elicitins, phytophthora, MAMPs, machine learning

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 11. 12. 2018

Thesis defence

• Date of defence: 15. 1. 2019
• Supervisor: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
• Reader: doc. Mgr. Miloslava Fojtová, CSc., doc. Mgr. Marek Petřivalský, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Doctoral programme / field:
Biochemistry (4-years) / Biochemistry