Aplikace metod molekulární biologie v popisu nových druhů parazitů a při revizi jejich taxonomie na příkladu podřádu Octomacrinea Khotenovsky, 1985.

Mgr. Kristína Civáňová, Ph.D.

Advanced ('rigorózní') thesis

Application of molecular biology methods in description of new parasite species and in revision of their taxonomy using suborder Octomacrinea Khotenovsky, 1985 as an example.

Abstract:

Tato rigorózní práce pojednává o využití moderních molekulárně biologických metod při popisu nových druhů monogeneí. V současné době je již nevyhnutné k morfologickým a morfometrickým údajům popisu jakéhokoli organizmu živočišní říše přikládat také alespoň částečnou charakterizaci genomových sekvencí blíže specifikujících jeho jedinečnost. Využitelnost a nevyhnutelnost aplikace metod molekulární biologie pro popis živočišných druhů práce demonstruje na příkladu podřádu Octomacrinea Khotenovsky. Základ práce tvoří vědecká publikace autorky z roku 2013 o popisu pro vědu nového druhu parazita z čeledě Diplozoidae, podčeleď Diplozoinae – Paradiplozoon bingolensis n. sp.. Tato je doplněna stručnou literární rešerší a dalšími původními výsledky z doposud nepublikované molekulární charakteristiky zástupců rodu Octomacrum z čeledi Octomacridae a rodu Paradiplozoon z čeledi Diplozoidae. Analýzou genomových regiónů ribozomální DNA (rDNA) u těchto parazitů byly odhaleny nesrovnalosti ve validitě již dříve publikovaných popisů zástupců rodu Paradiplozoon a také v jejich taxonomickém zařazení. Další výsledky uváděné v této práci přispějí k popisu nových druhů parazitů a mohou sloužit k plánované částečné redeskripci rodu Paradiplozoon případně celé čeledi Diplozoidae.

Abstract:

This thesis is about description of new parasite species using the modern approach of molecular-biological methods. Nowadays, for the description of any organism of the animal kingdom, it is already inevitable to include at least partial characterization of genome sequences specifying its uniqueness in more detail into morphological and morphometrical data. Application and the need of using molecular biology methods when describing species, is what this thesis illustrates. Author chose suborder Octomacrinea Khotenovsky as an example. The thesis is built around author’s scientific paper about description of a parasite from family Diplozoidae, subfamily Diplozoinae – Paradiplozoon bingolensis n. sp., which is completely new to science. This paper is further defined by a short literature review and both original and new results of still unpublished molecular characterization of representatives of genera Octomacrum from family Octomacridae and Paradiplozoon from family Diplozoidae. When analyzing genomic regions of ribosomal DNA (rDNA) in these parasites, several validity discrepancies in previously published descriptions of Paradiplozoon representatives and in their taxonomical inclusion were revealed. Additional results presented in this thesis will contribute to description of new parasite species and may serve for planned redescription of genus Paradiplozoon or maybe even whole Diplozoidae family.

Keywords

Octomacrinea, Octomacridae, Diplozoidae, rDNA, Paradiplozoon bingolensis, nový druh parazita, molekulární fylogeneze, new parasite species, molecular phylogenesis

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 23. 10. 2014

Thesis defence

• Date of defence: 19. 1. 2015
• Reader: doc. RNDr. Andrea Vetešníková Šimková, PhD., prof. MVDr. Břetislav Koudela, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Advanced ('rigorózní řízení') programme / field:
Ecological and Evolutionary Biology / Zoology