Výzkum Nekanonických Nukleových Kyselin Pomocí Simulací Molekulární Dynamiky – Zhengyue Zhang, MSc.
Zhengyue Zhang, MSc.
Doctoral thesis
Výzkum Nekanonických Nukleových Kyselin Pomocí Simulací Molekulární Dynamiky
Investigations of Noncanonical Nucleic Acids Using Molecular Dynamics Simulations
Abstract:
Nekanonické struktury nukleových kyselin hrají klíčové role v řadě biologických procesů. Simulace molekulární dynamiky (MD) prokázaly pozoruhodné schopnosti při objasňování biomolekulární dynamiky s vysokým prostorovým a časovým rozlišením. Přesnost MD při reprodukci struktur a dynamiky nukleových kyselin, zejména nekanonických DNA a RNA struktur, však naráží na několik překážek. Tato práce poskytuje …moreAbstract:
Noncanonical nucleic acid structures, which play crucial roles in a variety of biological processes, deserve in-depth investigations. Molecular Dynamics (MD) simulations have shown remarkable capabilities for elucidating biomolecular dynamics at high spatial and temporal resolutions. However, the accuracy of MD in reproducing the structures and dynamics of nucleic acids, particularly noncanonical DNA …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 7. 2. 2024
Identifier:
https://is.muni.cz/th/nyj4b/
Thesis defence
- Date of defence: 30. 4. 2024
- Supervisor: prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Reader: doc. RNDr. Petr Jurečka, Ph.D., Mgr. Stanislav Kozmon, Ph.D., doc. Ing. Filip Lankaš, PhD.
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
ZHANG, Zhengyue. \textit{Výzkum Nekanonických Nukleových Kyselin Pomocí Simulací Molekulární Dynamiky}. Online. Doctoral theses, Dissertations. Brno: Masaryk University, Faculty of Science. 2024. Available from: https://theses.cz/id/kanpzg/.
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakultaMasaryk University
Faculty of ScienceDoctoral programme / field:
Life Sciences / Life Sciences
Theses on a related topic
-
Analýza rekurentních mutací v genomech vybraných lidských virů a jejich překryvů se sekvencemi schopnými tvořit nekanonické struktury nukleových kyselin
Amanda FROMELIUSOVÁ -
Strukturní bioinformatika G-kvadruplex vazebných proteinů a jejich interakcí s nekanonickými formami nukleových kyselin
Jiří MARZOLL -
Molecular dynamics simulations of arginine rich peptides at biological membranes
Daniil Victorov -
Computational tools for the analysis of biomolecular data obtained by NMR and molecular dynamics simulations
Petr Novák -
The study of protein unfolding utilizing molecular dynamics simulation
Veronika Szotkowská -
Molekulárně dynamické simulace viskozit technologicky významných kapalin v reálných systémech
Daniel Himr -
Počítačové simulace strukturní dynamiky guaninových kvadruplexů
Barbora Knappeová -
Parametrizace silového pole pro molekulárně dynamické simulace analogů nukleotidů nukleových kyselin
Michal Růžička