Chemické látky stabilizující G-kvadruplexy

Sabina BAJTKOVÁ

Bakalářská práce

Chemicals stabilizing G-quaduplexes

Anotace:

Nukleové kyseliny, které jsou bohaté na guaniny a mají tendenci k tvorbě čtyřvláknových DNA struktur, nazýváme G-kvadruplexy. Stavební jednotkou této struktury jsou G-kvartety, které tvoří planární uspořádání čtyř guaninů spojených Hoogsteenovou vazbou. G-kvadruplex může vytvářet dvě struktury, intramolekulární a intermolekulární. Výskyt G4 byl potvrzený v mnoha významných biologických strukturách. Do takových oblastí patří telomery, promotorové oblasti některých onkogenů, jako jsou např. c-MYC, Bcl-2 a c-kit. Nalezneme je i v jiných oblastech genomu, v RNA a také v nehumánních oblastech, např. u virů. V posledních letech jsou atraktivním cílem ligandy, které by mohly pomoci k regulaci stability G-kvadruplexu. Mnohé tyto ligandy se využívají na terapeutické cíle.

Abstract:

Guanine-rich nucleic acid sequences can fold into four-stranded DNA structures that are known as G-quadruplexes. The building blocks of these structures are G-quartets that form into planar arrangements of four guanine bases linked by Hoogsteen hydrogen bond. G-quadruplexes can form two structures - intramolecular and intermolecular. The occurrence of G4 was confirmed in a number of significant biological structures. These regions include telomere, the promoter regions of certain oncogenes, such as c-MYC, Bcl-2 and c-kit. They are also found in other regions of the genome and RNA, as well as in non-human regions, such as viruses. In recent years, ligands, that could help to regulate the stability of the G-quadruplexes, have been an attractive target. Many of these ligands are used for therapeutic purposes.

Klíčová slova

G-kvadruplex, G-kvartet, guanin, ligand

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 4. 2020

Zveřejnit od: 31. 12. 2999

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 12. 6. 2020
• Vedoucí: Doc. RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie