Výpočet profilů Gibbsovy energie chemické reakce pomocí ab initio molekulové dynamiky kombinované s metodou Umbrella sampling – Pavel CHMELAŘ
Pavel CHMELAŘ
Bachelor's thesis
Výpočet profilů Gibbsovy energie chemické reakce pomocí ab initio molekulové dynamiky kombinované s metodou Umbrella sampling
Calculation of the Gibbs energy profile of the chemical reaction using ab initio molecular dynamic in combination with Umbrella sampling method
Anotácia:
Tato bakalářská práce si kladla za cíl otestovat metodu pro výpočty profilů Gibbsovy energie, která bude používat Umbrella sampling techniku v kombinaci s hybridním QM/MM popisem systému a ADMP propagací vlnové funkce.Tato metoda je nejvhodnějším řešením pro studium mechanismů enzymatických a ribozomových reakcí. Velký důraz byl kladen zejména na optimalizaci časové náročnosti simulací a na spotřebu …viacAbstract:
The aim of the bachelor thesis was testing of the method calculating Gibbs energy profile that uses Umbrella sampling method in combination with the hybrid QM/MM description and the ADMP wave function propagation. This method is the most appropriate solution for studying the mechanisms of enzymatic and ribozyme reactions. The study was focused mainly on the optimization of the time and computational …viacKľúčové slová
QM/MM Umbrella sampling WHAM PES profil Gibbsovy energie ADMP methylchlorid CH3Cl Gaussian MPW1K
Jazyk práce: Czech
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 1. 2012
Zverejniť od: 17. 1. 2012
Obhajoba závěrečné práce
- Vedúci: Mgr. Pavel Banáš
Citační záznam
Citace dle ISO 690:
CHMELAŘ, Pavel. \textit{Výpočet profilů Gibbsovy energie chemické reakce pomocí ab initio molekulové dynamiky kombinované s metodou Umbrella sampling}. Online. Bakalárska práca. Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci, Faculty of Science. 2012. Dostupné z: https://theses.cz/id/kwko98/.
Jak správně citovat práci
CHMELAŘ, Pavel. Výpočet profilů Gibbsovy energie chemické reakce pomocí ab initio molekulové dynamiky kombinované s metodou Umbrella sampling. Olomouc, 2012. bakalářská práce (Bc.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta
Plný text práce
Právo: Autor si přeje zpřístupnit práci veřejnosti od 17.1.2012
Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:- Soubory jsou od 17. 1. 2012 dostupné: světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI, Přírodovědecká fakultaPALACKÝ UNIVERSITY IN OLOMOUC
Faculty of ScienceBachelor programme / odbor:
Chemistry / Management in Chemistry
Práce na příbuzné téma
-
Pes baskervillský: případ dobré adaptace
Sonya Mátlová -
Není pes jako pes aneb náklady a výnosy vodicích a asistenčních psů v České republice
Pavla Vašíčková -
Pes pomocník - asistenční pes, jeho výchova a využití
Lucie Jakešová -
Diverzifikace akustické struktury štěkání psů různých plemen: Německý ohař krátkosrstý, jezevčík, bernský salašnický pes, hladkosrstý retrívr, labradorský retrívr
Anna Fišerová -
Pes jako reminiscenční stimul
Markéta Proboštová -
Pes v antropologickém kontextu doby římské
Jana Sahulová -
Absolventský výkon: dramaturgie inscenace Mrtvý pes v čistírně: Silní v Divadelním studiu Marta
Matěj Nytra -
Pes v antropologickém kontextu mladého pravěku
Jana Sahulová
Názov
Vložil
Vložené
Práva