Taxonomická charakteristika melanizovaných mikroskopických hub osídlujících horniny Antarktidy

Bc. Anna Manová

Master's thesis

Taxonomic characterization of melanised microscopic fungi inhabiting the rocks of Antarctica

Anotácia:

Horniny osídlující houby (RIF) jsou ekologická skupina mikroskopických hub vyskytujících se takřka po celém světě. Jejich morfologické a fyziologické adaptace jim pomáhají překonávat podmínky mrazivých pouští Antarktidy, ale také rozžhavené povrchy středomořských hornin a nacházet tak životní prostor i na místech, kde mnoho jiných organismů není schopno přežít. Mnoho nových rodů těchto mikroskopických hub bylo popsáno v posledních 20 letech za použití moderních molekulárně genetických nástrojů a jejich počet stále narůstá. Z tohoto důvodu se i taxonomie této skupiny neustále vyvíjí. Tato diplomová práce se věnuje charakterizaci 15 kmenů RIF pocházejících z hornin ostrova Jamese Rosse na Antarktidě. U vybrané skupiny kmenů byly hodnoceny morfologické a fyziologické vlastnosti. Fyziologická analýza zahrnovala stanovení teplotních preferencí, srovnání růstu na vybraných médiích a hodnocení odolnosti k vyšším koncentracím NaCl. K objasnění taxonomické příslušnosti vybrané skupiny kmenů byla použita fylogenetická analýza tří oblastí genomu (ITS, LSU, RPB2) a druhové hranice byly vymezeny dle GCPSR konceptu.

Abstract:

Rock-inhabiting fungi (RIF) are an ecological group of microscopic fungi found almost worldwide. Their morphological and physiological adaptations help them to overcome the freezing conditions of the Antarctic deserts as well as the heated surfaces of Mediterranean rocks, finding habitat in places where many other organisms are unable to survive. Many new genera of these microscopic fungi have been described in the last 20 years using modern molecular genetic tools, and their numbers continue to grow. For this reason, the taxonomy of this group is constantly evolving. This thesis focuses on the characterization of 15 RIF strains originating from the rocks of James Ross Island, Antarctica. Morphological and physiological characteristics were evaluated in a selected group of strains. The physiological analysis included determination of temperature preferences, comparison of growth on selected media and evaluation of resistance to higher NaCl concentrations. Phylogenetic analysis of three regions of the genome (ITS, LSU, RPB2) was used to clarify the taxonomic affiliation of the selected group of strains and species boundaries were defined according to the GCPSR concept.

Kľúčové slová

Antarktida, horniny osídlující houby, meristematické houby, multilokusová fylogeneze, RIF, stresová tolerance, Antarctica, meristematic fungi, multilocus phylogeny, rock-inhabiting fungi, stress tolerance

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 21. 6. 2022
• Vedúci: Ing. Monika Laichmanová, Ph.D.
• Oponent: RNDr. David Novotný, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Microbiology / Microbiology