Analýza a charakteristika vybraných polymorfních mikrosatelitů z řádu trubkonosí u čápa bílého (Ciconia ciconia)

Bc. Petra KRŇÁVKOVÁ

Diplomová práce

The analysis and characterization of selected polymorphic microsatellites from order Procellariiformes in White Stork (Ciconia ciconia).

Anotace:

Tato diplomová práce se věnuje analýze a charakteristice vybraných polymorfních mikrosatelitů, které byly nalezeny u čápa bílého (Ciconia ciconia) prostřednictvím cross-species PCR amplifikace. Teoretická část se zaobírá systémem recentních ptáků, dále popisem čápa bílého, jeho chováním, migrací, hnízděním, systémem páření, potravou, karyotypem a charakterizací heterochromatinu. Další kapitoly se zabývají charakteristikou mikrosatelitů, dále pak mikrosatelity u druhů z čeledi čápovití, a to těmi které byly popsány de novo a také pomocí cross-species PCR amplifikace. Experimentální část se zabývá cross-species PCR amplifikací s použitím 18 párů primerů, které byly nalezeny u zástupců z řádu trubkonosí a poskytly polymorfní produkt v mé bakalářské práci (Krňávková, 2021). Tyto páry primerů byly testovány na genomické DNA 23 nepříbuzných jedinců čápa bílého a 17 z nich poskytlo polymorfní produkt. Všechny lokusy byly charakterizovány na základě populačně-genetických parametrů a žádná dvojice mikrosatelitů není ve vazbě.

Abstract:

This master thesis is devoted to the analysis and characterization of selected polymorphic microsatellites that were found in the white stork (Ciconia ciconia) through cross-species PCR amplification. The theoretical part is dealing with the system of recent birds, further is describing the white stork, its behavior, migration, nesting, mating system, food, karyotype and characterization of heterochromatin. Other chapters deal with the characteristics of microsatellites, then microsatellites in species from the stork family, namely those that have been described de novo and also by means of cross-species PCR amplification. The experimental part deals with cross-species PCR amplification using 18 primer pairs, which were found in representatives of the order of Procellariiformes and provided a polymorphic product in my bachelor thesis (Krňávková, 2021). These primer pairs were tested on the genomic DNA of 23 unrelated white stork individuals and 17 of them gave a polymorphic product. All loci were characterized on the basis of population-genetic parameters and no pair of microsatellites is linked.

Klíčová slova

Čáp bílý, mikrosatelity, cross-species PCR amplifikace, Ciconia ciconia, trubkonosí

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 28. 4. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Petr Nádvorník, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Molekulární a buněčná biologie / Molekulární a buněčná biologie