Příprava vzorků pro zobrazovací hmotnostní spektrometrii

Bc. Daniela Petříková

Master's thesis

Sample Preparation for Mass Spectrometry Imaging

Abstract:

Tato diplomová práce se zabývá přípravou vzorků pro zobrazovací hmotnostní spektrometrii s laserovou desorpcí a ionizací za účasti matrice (MALDI MSI). Jako vzorky byly použity 3D buněčné modely označované jako sferoidy, které lépe imitují in vivo prostředí tkáně než běžně používané 2D modely. V teoretické části jsou shrnuty informace o buněčných modelech a metodách jejich pěstování, ionizačních technikách používaných pro MSI a jednotlivých krocích zpracování vzorku. V praktické části jsou popsány všechny metody a podmínky použité při zpracování vzorků. Na jejich základě byl doporučen nejvhodnější postup zpracování vzorku pro MALDI MSI.

Abstract:

This diploma thesis deals with the sample preparation for matrix assisted laser desorption ionization mass spectrometry imaging (MALDI MSI). As samples, 3D cell models called spheroids were used, as they mimics better in vivo tissue environment compared to commonly used 2D models. The theoretical part summarizes information on cell models and methods of their cultivation, ionization techniques used for MSI and individual steps of sample preparation. In the practical part, all techniques that were used during sample preparation are described. Based on this, the most appropriate sample preparation procedure for MALDI MSI was recomended.

Keywords

MALDI, zobrazovací hmotnostní spektrometrie, zpracování vzorku, sublimace, sferoidy, buněčná linie HT-29 MALDI, Mass Spectrometry Imaging, sample preparation, sublimation, spheroids, cell line HT-29

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 15. 5. 2018

Thesis defence

• Date of defence: 11. 6. 2018
• Supervisor: prof. Mgr. Jan Preisler, Ph.D.
• Reader: prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Biochemistry / Bioanalyst - Specialist in Laboratory Methods