Nové nanobiotechnologické metody pro výzkum poškození DNA na úrovni jednotlivých molekul

Bc. Veronika Horňáková, Ph.D.

Master's thesis

DNA damage analysis on a single molecular level

Anotácia:

Diplomová práce je zaměřena na výzkum poškození DNA na úrovni jednotlivých molekul prostřednictvím mikroskopie atomárních sil (AFM). AFM je nejrozšířenější odnoží mikroskopie se skenující sondou (SPM), která pracuje na principu těsného přiblížení měřící sondy ke vzorku. Teoretická část zahrnuje popis skenovacích mikroskopických technik, zejména samotný mikroskop AFM, jeho instrumentaci, jednotlivé měřící módy a měřící techniky. V neposlední řadě práce zahrnuje informace o podkladních materiálech, jejich přípravě před samotným měřením a způsoby imobilizace vzorků na tyto nosiče. Experimentální část se zabývá jak optimalizací metod pro přípravu vzorků samotné DNA a její imobilizací na vhodné nosiče pro měření pomocí mikroskopu AFM, tak i možností nespecifického a specifického značení DNA vazbou protilátky za účelem vizualizace jejich poškozených částí.

Abstract:

The thesis is focused on the research of DNA damage at the level of individual molecules by atomic force microscopy (AFM). AFM is the most common type of scanning probe microscopy (SPM), which works by a close approach of measuring probe to the sample surface. The theoretical part includes a description of scanning microscopy techniques, namely AFM microscope itself, its instrumentation setup, measuring modes and different measuring techniques. Finally, the work mentions substrates, their preparation before the actual measurement and methods of immobilization of samples on the carrier. The experimental part deals with the optimization of methods for sample preparation of DNA itself and its immobilization on a suitable surfaces for AFM measurements using a AFM microscope, and the possibility of nonspecific and specific labeling of DNA by bound antibodies for visualization of the damaged parts.

Kľúčové slová

SPM, STM, AFM, Mikroskopie atomárních sil, DNA, protein, komplex DNA-protein, imobilizace, slída, Atomic Force Microscopy, complex DNA-protein, immobilization, mica

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 5. 6. 2012
• Vedúci: Mgr. Jan Přibyl, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biochemistry / Analytical Biochemistry