Analýza N-terminálních sekvencí bakteriálních lektinů

Bc. Daniela Repelová

Bakalářská práce

Analysis of N-terminal sequences from bacterial lectins

Abstract:

The bachelor thesis is focused on an in silico analysis of N-terminal sequences of five homologous lectins from Gram-negative bacterium Photorhabdus laumondii (PLL-PLL5). The N-terminal sequences mostly serve as a signal that determines by which mechanism and where the protein will be transported after the synthesis. However, the N-terminal sequences of these lectins do not exhibit the typical properties of signal peptides. In addition, their complete structure and function is not known. The aim of this work was to analyze these sequences and predict their properties, secondary structure and potential functions.

Abstract:

Bakalářská práce se zabývá in silico analýzou N-terminálních sekvencí pěti homologních lektinů z Gram-negativní bakterie Photorhabdus laumondii (PLL-PLL5). N-terminální sekvence slouží většinou jako signál, který určuje, jakým mechanizmem a kam bude protein po syntéze transportovaný. Avšak N-terminální sekvence těchto lektinů nevykazují typické vlastnosti signálních peptidů. Navíc není známa ani jejich úplná struktura a neví se, jaká je jejich funkce. Cílem této práce bylo analyzovat tyto sekvence a predikovat jejich vlastnosti, sekundární strukturu a potenciální funkce.

Klíčová slova

N-terminální sekvence, signální peptid, Photorhabdus laumondii, predikce, N-terminal sequence, signal peptide, prediction

Jazyk práce: slovenština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 1. 6. 2021

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 7. 2021
• Vedoucí: Mgr. Josef Houser, Ph.D., prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
• Oponent: RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Chemoinformatika a bioinformatika