Využití cirkulujících mikroRNA v diagnostice pacientů s karcinomem rekta

Bc. Dominika Brchnelová

Bachelor's thesis

Usage of circulating microRNAs in diagnosis of rectal cancer

Abstract:

Colorectal carcinoma is one of the most common malignancies in an adult population and accounts for approximately 9 % of all malignancies. The Czech Republic has one of the highest incidences of colorectal carcinoma worldwide. Colorectal carcinoma localized in the rectum differs in tissue character from carcinoma localized in the colon and is characteristic by higher invasiveness and a complicated surgery. MicroRNAs are short non-coding RNAs engaged in the regulation of many genes connected with carcinogenesis. Their exceptional stability in bodily fluids and frequent deregulation in pathological states make them a suitable biomarker. The goal of this thesis was to use the next generation sequencing method as a tool for express profiling of microRNAs obtained from rectal carcinoma patients’ blood plasma and to compare microRNA profiles of patients with different clinicopathological data. The presence of selected microRNAs was confirmed in exosomes produced by cells derived from colorectal carcinoma cells.

Abstract:

Kolorektální karcinom je jedním z nejčastějších nádorových onemocnění dospělé populace a představuje přibližně 9 % všech nádorových onemocnění. Česká republika zaujímá celosvětově přední příčky v jeho incidenci. Kolorektální karcinom vyskytující se v oblasti rekta se povahou tkáně odlišuje od tkáně tlustého střeva a tyto karcinomy se vyznačují vyšší invazivitou a komplikovaným chirurgickým odstraněním nádoru. MikroRNA jsou krátké nekódující RNA zapojené do regulace mnohých genů spojených s kancerogenezí. Jejich mimořádná stabilita v tělních tekutinách a častá deregulace u patologických stavů je činí vhodnými biomarkery. Cílem této práce bylo využití metody sekvenování nové generace jako nástroje pro expresní profilování mikroRNA získaných z krevní plazmy pacientů s karcinomem rekta a porovnání mikroRNA profilů pacientů s odlišnými klinicko-patologickými údaji. Přítomnost vybraných mikroRNA byla ověřena v exozómech produkovaných buňkami odvozenými od kolorektálního karcinomu.

Kľúčové slová

karcinom rekta, mikroRNA, sekvenování nové generace, rectal carcinoma, microRNA, next-generation sequencing

Jazyk práce: Slovak

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 11. 5. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 14. 6. 2017
• Vedúci: doc. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biochemistry / Biochemistry