Studium interakcí peptidů s organickými molekulami metodami molekulového modelování

Bc. Daniela Machová

Master's thesis

Study of interactions between proteins and organic molecules using molecular modeling methods

Anotácia:

Tato diplomová práce je zaměřena na studium konformačního chování amyloidu β, který je tvořen v průběhu Alzheimerovy choroby. V první teoretické části této práce je souhrn dostupných znalostí o amyloidu β a cholinergními systému. K symptomatické léčbě Alzheimerovy choroby se využívá takrin a 7-methoxytakrin působící terapeuticky tím, že inhibují cholinesterasy a zvyšují tak hladinu acetylcholin. Choliesterasa má také podíl na agregaci amyloidu β a vzniku amyloidních plaků, jejichž neutrotoxicita hraje klíčovou roli v patogenezi Alzheimerovy choroby. Terapeutický efekt takrinu a 7-methoxytakrin by nemusel být zaměřen na pouhou inhibici cholinestaras, proto v druhé praktické části této práce studujeme konformační chování amyloidu β s takrinem nebo 7-methoxytakrin a pomocí molekulově dynamických simulací zkoumáme konformační změny vyvolané touto interakcí.

Abstract:

This diploma thesis is focused on the study of conformational behavior of amyloid β, which is created during Alzheimer's disease. In the first theoretical part of this work is summary of available knowledge about the amyloid β and the cholinergic system.For the symptomatic treatment of Alzheimer's disease are used tacrin and 7-methoxytacrin, which cause therapeutically by inhibiting cholinesterase and they increase level of acetylcholine. Cholinesterase has part of aggregation of amyloid β and formation of amyloid plaques, which are neurotoxic and play key role in the pathogenesis of Alzheimer's disease. Therapeutic effect of tacrine and 7-methoxytacrin should not be only focused on inhibition cholinestarase, therefore in the second practical part of this paper, we study the conformational behavior of amyloid β with tacrine or 7-methoxytacrin and use of molecular dynamics simulations research conformational changes cause by this interaction.

Kľúčové slová

Alzheimerova chorob, amyloid β, cholinergní systém, takrin, 7-methoxytakrin, molekulové modelování, Alzheimer’s disease, cholinergic system, tacrin, 7-methoxytacrin, molecular modeling

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 24. 6. 2015
• Vedúci: Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biochemistry / Biomolecular Chemistry