Sledování změny genové exprese u necílového organismu Eisenia foetida v reakci na aplikaci pesticidů

Adam PUT

Bakalářská práce

Differential gene expression in non-target organism Eisenia foetida in response to pesticides treatment

Anotace:

Pesticidy se v zemědělském průmyslu používají k hubení parazitických organismů za účelem maximalizace výnosu produktů. Tyto pesticidy cílí na specifický molekulárně biologický proces daného parazita, jehož narušením mohou způsobit změny chování s cílem úniku z pesticidy naočkovaných plodin, inhibici reprodukce či přímo smrt. Mimo cílové organismy jsou pesticidy toxické také vůči necílovým organismům, jejichž půdní modelový zástupce je žížala Eisenia fetida. Tato práce se zabývá shrnutím poznatků o vlivu pesticidů na genové expresi této žížaly pomocí metod qRT-PCR a RNA-sekvencování. Tyto metody umožňují detekovat relativně přesné změny genové exprese vůči různým koncentracím pesticidu, díky čemuž lze určit toxicitu daného pesticidu a případně navrhnout jeho zamítnutí nebo omezení na prahovou dávku.

Abstract:

Pesticides are heavily used in agricultural industry to kill parasitic organisms to maximize yield production. These pesticides target and disrupt specific molecular biological process of targeted parasite which could lead to behaviour changes such as trying to escape from a treated crop, inhibition of reproduction or even death. Pesticides also have toxic effect to a nontarget organisms such as a model earthworm Eisenia fetida. This thesis summarizes knowledge about pesticides effect to gene expression of the earthworm measured by qRT-PCR and RNA-seq methods. These methods can detect differential gene expression to different pesticide concentrations which leads to determination of toxic effect of the specific pesticide. Results can help to determine whether specific pesticide should be banned or should have threshold concentration.

Klíčová slova

změny exprese genu, pesticidy, Eisenia fetida, NGS, qRT-PCR, RNA-seq, biomarker, toxikogenomika

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 10. 8. 2021

Zveřejnit od: 31. 12. 2999

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 9. 2021
• Vedoucí: Mgr. Jiří Červeň

OSTRAVSKÁ UNIVERZITA

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie