Vlastnosti proteinu fibrilarin se zaměřením na jeho interakce s nukleovými kyselinami

Bc. Maxim Žilinec

Bachelor's thesis

Properties of the fibrilarin protein with a focus on its interactions with nucleic acids

Abstract:

Fibrilarin je S-adenosyl-L-metionin dependentní metyltransferáza snoRNP komplexů. Nachází se v DFC regionu jadérek a jeho funkcí je metylace rRNA, zpracovávání pre-rRNA, regulace sestavování ribozo-mů metylace histonu 2A. Tento protein je složený ze tří domén. N-terminální doména má lokalizační funkci a zprostředkovává ribonukle-ázovou aktivitu fibrilarinu. Centrální doména váže RNA a společně s C-terminální doménou tvoří metyltransferázovou doménu. Vyšší exprese fibrilarinu je typická pro některé nádory. RNA viry fibrilarin využívají pro transport do jadérek.

Abstract:

Fibrillarin is an S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransfer-ase of snoRNP copmplexes. It can be found in the DFC region of the nu-cleolus and its function is rRNA methylation, pre-rRNA processing, ri-bosome assembly regulation, histone 2A methylation. This protein is made up of three domains. The N-terminal domain has a localization function and mediates the fibrillarin ribonuclease activity. The central domain binds to RNA and, together with the C-terminal domain, forms the methyltransferase domain. Higher expression of fibrillarin is typical for certain tumors. RNA viruses use fibrillarin to transport into nucleoli.

Keywords

Fibrilarin, rRNA, jadérko, snoRNA, metylace Fibrillarin, nucleolus, methylation

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 3. 1. 2023

Thesis defence

• Date of defence: 6. 2. 2023
• Supervisor: prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D.
• Reader: Mgr. Markéta Pernisová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Experimental and Molecular Biology / Molecular Biology and Genetics