Bakterie čeledi Bifidobacteriaceae

Pavlína Mironiuková

Bakalářská práce

Bacteria of the Bifidobacteriaceae family

Anotace:

Složení střevní mikroflóry hraje důležitou roli při udržení zdraví, o které se starají užitečné bakterie v gastrointestinálním traktu zvířat a lidí. Při poruše složení nebo vymizení prospěšných bakterií ve střevech může dojít k rozšíření patogenů, které způsobují zdravotní potíže. Mezi významné bakterie, které přirozeně ovlivňují imunitní systém, funkci jater, ledvin, střev a ostatních orgánů, patří bakterie čeledi Bifidobacteriaceae.Proto bylo cílem bakalářské práce sestavit podrobný přehled a popis nejnovějších bakteriálních druhů a rodů, které patří do této čeledi za posledních 11 let. Do rodu Bifidobacterium přibylo celkem 28 druhů a 4 poddruhy Bifidobacterium longum. Mezi nově popsané rody patří Bombiscardovia, Galliscardovia, Neoscardovia a Pseudoscardovia. K ucelení kompletního přehledu byly popsány i rody, které byly objeveny v dřívějších letech jako je např. rod Aeriscardovia, Gardnerella, Metascardovia a Parascardovia. Do rodu Scardovia jsou zařazeny 2 druhy, přičemž nejnovější bakterie S. wiggsiae byla objevena před 7 lety. Poslední rod patřící do této čeledi je rod Alloscardovia, do kterého patří 4 bakteriální druhy. Z roku 2017 je nově popsaným druhem A. venturai a v roce 2013 A. criceti a A. macacae.Kromě charakterizace jednotlivých bakteriálních rodů čeledi Bifidobacteriaceae je v této práci uvedena i taxonomie bakterií a stručný popis metod identifikace. V současnosti se pro popis bakteriálních druhů používá kombinace fenotypových a genotypových metod, tzv. polyfázický přístup. Bakterie se rozlišují podle morfologických, kultivačních a fyziologických charakteristik, na které navazují molekulárně biologické testy, které jsou založené na analýze DNA. Patří sem zejména stanovení sekvence genu pro 16S rRNA a pro hsp60. Díky těmto metodám lze rozlišit i fenotypově nerozlišitelné druhy bakterií.

Abstract:

The composition of the intestinal microflora plays an important role in maintaining the health, about which the useful bacteria care in the gastrointestinal tract of animals and humans. At a failure of the composition or disappearance of the beneficial bacteria in the gut may occur to the expansion of pathogens, which cause health problems. Among the important bacteria that affect naturally the immune system, liver function, kidneys, intestines and other organs, include bacteria of the Bifidobacteriaceae family. It was therefore the aim of this bachelor thesis to compile a detailed overview and description of the latest bacterial species and genera belonging to this family for the past 11 years. To the genus Bifidobacterium were added a total of 28 species and 4 subspecies of Bifidobacterium longum. The newly described genera are Bombiscardovia, Galliscardovia, Neoscardovia and Pseudoscardovia. To the completion of a complete review have been described and genera that have been discovered in earlier years, such as the genus Aeriscardovia, Gardnerella, Metascardovia and Parascardovia. To the genus Scardovia are included 2 species, with the most recent bacteria S. wiggsiae has been discovered 7 years ago. The last genus belonging to this family is the genus Alloscardovia, which includes the 4 bacterial species. A. venturai is a newly described species since 2017. A. macacae and A. criceti are the newly described species since 2013. My bachelor thesis include the taxonomy of bacteria and a brief description of the methods of identification besides characterization of individual bacterial genera of the Bifidobacteriaceae family. For the description of bacterial species use a combination of phenotypic and genotypic methods in present day, so called polyphasic approach. Bacteria are identified according to morphological, cultural and physiological characteristics, followed by molecular biological tests, which are based DNA analysis. This includes particularly the determination of the gene sequence for 16S rRNA and hsp60. Thanks to these methods can be also distinguished phenotypically indistinguishable species of bacteria.

Klíčová slova

Bifidobacterium, Aeriscardovia, Alloscardovia, Gardnerella, Bombiscardovia, Metascardovia, Parascardovia, Scardovia, Pseudoscardovia, taxonomie, identifikace

Keywords

Bifidobacterium, Aeriscardovia, Alloscardovia, Gardnerella, Bombiscardovia, Metascardovia, Parascardovia, Scardovia, Pseudoscardovia, taxonomie, identifikace

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 20. 4. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: prof. Ing. Eva Vlková, Ph.D.
• Oponent: Hana Salmonová, Ing.

Česká zemědělská univerzita v Praze

Fakulta agrobiologie, potravinových a přírodních zdrojů

Bakalářský studijní program / obor:
Zootechnika / Speciální chovy