Sledování cytogenetických změn chromozomu 18 u kolorektálního karcinomu

Bc. Zuzana LOUBALOVÁ

Master's thesis

Abstract:

Chromozomální nestabilita (CIN) je jednou z typických cest, které vedou k maligní transformaci a vzniku kolorektálního karcinomu. Charakterizuje ji rozsáhlá nerovnováha v počtu chromozomů (aneuploidie) a genetické aberace. Chromozomální nestabilita je spojena s nepříznivou prognózou a lékovou rezistencí, ale také se předpokládá její asociace s chybami v průběhu mitózy. Jako nejčastější genetická změna u kolorektálního karcinomu (CRC) bývá popisována delece v chromozomu 18q a tato ztráta je markerem pro špatnou prognózu. Byl hledán kandidátní gen, jehož delece je zodpovědná za špatnou prognózu a léčbu tohoto onemocnění. Vhodným kandidátem se jevil gen DCC (Deleted in colorectal carcinoma), potenciální tumor supresorový gen, jeho vliv však nebyl nikdy přesvědčivě dokázán. Nedávno bylo zjištěno, že v této oblasti jsou lokalizovány další tři CIN supresorové geny, jejichž umlčení vede k replikačnímu stresu, abnormalitám ve struktuře chromozomů a chybné segregaci chromozomů v průběhu mitózy. Těmito geny jsou ZNF516 (Zinc-finger protein 516), PIGN (Phosphatidylinositol Glycan Anchor Biosynthesis Class N) a MEX3C (Mex-3 RNA Binding Family Member C). Delece v oblasti 18q je popisována v různém rozsahu, u jednotlivých pacientů s delecí 18q tedy může docházet ke ztrátě jednoho či více těchto genů, včetně DCC. Cílem práce bylo zjistit, jaký vliv má rozsah delece 18q (resp. delece genů DCC, ZNF516, PIGN a MEX3C) na průběh onemocnění a zda by některý z uvedených genů mohl být využit jako prognostický faktor, případně jako cíl pro budoucí biologickou léčbu.

Abstract:

Chromosomal instability (CIN) is one of the typical pathways, which lead to malignant transformation and formation of colorectal cancer. It is characterized by widespread imbalance in chromosome number (aneuploidy) and genetic aberations. Chromosomal instability is associated with poor prognosis and drug resistance and it is thought to be associated with errors in mitosis. 18q deletion has been described as the most common genetic variation in colorectal cancer (CRC) and this loss is a marker for poor prognosis. Candidate gene whose deletion is responsible for poor prognosis and treatment of this disease was searched. As a potential tumor suppressor gene was proposed DCC (Deleted in Colorectal Carcinoma) gene, but its influence has never been conclusively proven. Recently, it was found that there are three CIN suppressor genes located on chromosome 18q, whose silencing leads to the replication stress, structural chromosome abnormalities and chromosome missegregation during mitosis. These genes are ZNF516 (Zinc-finger Protein 516), PIGN (Phosphatidylinositol Glycan Anchor Biosynthesis Class N) a MEX3C (Mex-3 RNA Binding Family Member C). Deletions of 18q have been observed in different range, the individual patients with 18q deletions may therefore have the loss of one or more of these genes, including DCC. The aim of the study was to determine the effect of a range of 18q deletion (accordingly deletion of DCC, ZNF516, PIGN and MEX3C genes) to disease progression and whether any of these genes could be used as a prognostic marker or as a target for future biological treatment.

Keywords

Kolorektální karcinom, chromozomální nestabilita, delece 18q, DCC, PIGN, MEX3C, ZNF516

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 2. 5. 2016

Accessible from:: 2. 5. 2016

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Radek Trojanec, Ph.D.

PALACKÝ UNIVERSITY OLOMOUC

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology