Molekulární typizace bakteriocinů produkovaných bakteriálními kmeny izolovanými z klinického materiálu

Bc. Barbora Štaudová

Diplomová práce

Molecular typing of bacteriocins produced by bacterial strains isolated from clinical material

Anotace:

Druh E. coli je běžnou součástí lidské střevní mikroflóry. Kmeny E. coli produkují dva typy bakteriocinů – koliciny a mikrociny. Jde o látky s antibiotickou povahou, které usmrcují bakterie stejného či blízce příbuzného druhu. Komensální kmeny E. coli z gastrointestinálního traktu (GIT) pacientů byly na základě klinického obrazu rozděleny do tří skupin. Kontrolní skupinu tvořilo 261 kmenů izolovaných od pacientů bez průjmového onemocnění. Soubor 237 kmenů E. coli pocházel od pacientů, kteří v době vyšetření trpěli bakteriálním průjmovým onemocněním způsobeným kmeny rodu Campylobacter nebo Salmonella. Třetí skupinu tvořily kmeny E. coli izolované od pacientů s diagnózou Crohnova choroba a ulcerozní kolitida. Kmeny E. coli, které byly izolovány z GIT pacientů s bakteriálním průjmovým onemocněním jsou častěji rezistentní k ampicilinu (62,5 %) oproti kontrole (43,45 %; p=0,014). Také častěji produkují mikrocin H47 (11,39%) oproti kontrole (6,51 %; p=0,045) a kmenům E. coli vyskytujícími se u pacientů se zánětlivým onemocněním střeva (2,96 %; p=0,038). Méně často se v této skupině vyskytuje genotyp B2 (34,6%) oproti kontrolním kmenům (44,83 %; p=0,02).

Abstract:

E. coli is a common component of human intestinal microflora. E. coli strains produce two types of bacteriocins - colicins and microcins. These antimicrobial substances are able to kills bacterial strains of the same or closely related species. Commensal strains of E. coli from GIT were isolated from three groups of patients. Control group consisted of 261 strains isolated from patients without bacterial diarrhea. Experimental group contained 237 strains from patients that suffered from bacterial diarrhea caused by strains of Campylobacter or Salmonella sp. Second Experimental group contained 67 strains from patients with Crohn disease and ulcerative colitis. Strains of E. coli isolated from patients with bacterial diarrhea were more frequently resistant to ampilicin (62,5%) compared to control strains (43,45 %; p=0,014). These strains also more often produced microcin H47 (11,39%) compared to control strains (6,51 %; p=0,045) and strains isolated from patients with inflammatory bowel disease (2,96 %; p=0,038). In this group of E. coli strains, genotype B2 was found less frequently (34,6 %) when compared to control strains (44,83 %; p=0,02).

Klíčová slova

Escherichia coli, bacteriocin, colicin, microcin, antibiotická rezistence, fylogenetické skupiny

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 17. 5. 2010

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 10. 6. 2010
• Vedoucí: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Obecná biologie