Studium exprese genů v živočišných tkáních metodou real-time PCR

Šárka Valentová

Bachelor's thesis

Gene expression study in animal tissues by real-time PCR

Abstract:

Studium genové exprese v živočišných tkáních umožňuje lepší porozumění fyziologie živočichů, díky kterému pak můžeme expresi genů kontrolovat či regulovat. Kvantitativní polymerázová reakce v reálném čase (real-time PCR), která studium genové exprese umožňuje, je vysoce flexibilní metodou. V současné době je k dispozici celá řada variant této technologie dle použité chemie a instrumentace. Optimální výsledky studií genové exprese vyžadují jasné pochopení této metody a přehled dostupných variant.Předkládaná bakalářská práce stručně popisuje metodu real-time PCR a jednotlivé varianty pro jejich následné srovnání z hlediska vhodnosti pro jednotlivé typy analýz a shrnuje význam studií exprese genů v biotechnologiích i klinické praxi.Dále je prakticky srovnána citlivost a zároveň výkonnost kvantifikačních přístrojů 7500 Real-Time PCR SYSTEM a Rotor-Gene Q. Porovnávány byly střední hodnoty naměřených Ct hodnot pomocí párového t-testu. Na základě výsledných dat je možné říci, že mezi přístroji není statisticky významný rozdíl, co se týče citlivosti a výkonnosti.

Abstract:

The gene expression study in animal tissues enables a better understanding of animal physiology which allows to control and regulate gene expression. Quantitative real-time PCR is a highly flexible method for studying gene expression. Several variants of the technology are currently available considering the chemistry and instrumentation used. Optimal results of gene expression studies require a clear understanding of this method and an overview of available variants. The bachelor thesis describes the real-time PCR method and its variants for their subsequent comparison in terms of suitability for different types of analysis and summarizes the main importance of gene expression studies in biotechnology and clinical practice.In addition, the sensitivity and the performance of the 7500 Real-Time PCR SYSTEM and Rotor-Gene Q instruments are compared. The mean values of measured Ct values have been compared by statistical t-test. The results conclude that there is no statistically significant sensitivity or performance difference between tested instruments.

Keywords

kvantifikace, mRNA, genová exprese, real-time PCR

Keywords

gene expression, real-time PCR, mRNA, quantification

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 26. 4. 2018

Thesis defence

• Supervisor: prof. RNDr. Aleš Knoll, Ph.D.

Mendel University in Brno

Faculty of AgriSciences

Bachelor programme / field:
Agrobiology / Molecular biology and biotechnology