Zpět na vyhledávání

Bc. Daniela KOTALOVÁ

Diplomová práce

Sestavení genomu cichlidy \kur{Crenicichla semifasciata} kombinací sekvencí z různých sekvenačních platforem

Anotace:
Tato studie vytváří de novo referenční genom Crenicichla semifasciata kombinací sekvenačních dat ze dvou platforem 10x Genomics a Oxford Nanopore Technologies. Data byla zpracována jak jednotlivě, tak hybridní assembly. Pro všechny sestavy genomu byla stanovena hodnocení spojitosti a úplnosti.
Abstract:
By a combination of sequencing data from two platforms 10x Genomics and Oxford Nanopore Technologies, this study creates a de novo reference genome of Crenicichla semifasciata. Data were processed by both individual and hybrid assembly. Contiguity and genome completeness evaluations were determined for all assemblies.
 

Klíčová slova

bioinformatika sestavení genomu hybridní assembly 10x Genomics Oxford nanopore BUSCO
 
Jazyk práce: čeština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 9. 12. 2022

Obhajoba závěrečné práce

  • Vedoucí: RNDr. Ing. Lubomír Piálek, Ph.D.

Citační záznam

Citovat tuto práci
Jak správně citovat práci

KOTALOVÁ, Daniela. Sestavení genomu cichlidy \kur{Crenicichla semifasciata} kombinací sekvencí z různých sekvenačních platforem. České Budějovice, 2022. diplomová práce (Mgr.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=62470 Odkaz na soubor do lokálního úložiště instituce

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie - specializace Molekulární a buněčná biologie a genetika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Theses mjrdnn mjrdnn/2
9. 12. 2022
Složky
Soubory
thesis DP_Kotalova.pdf
Bulánová, L.
10. 12. 2022

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.