Výskyt a diagnostika Campylobycter jejuni v České republice

Lukáš HOLER

Bakalářská práce

The occurrence and the diagnosis of Campylobacter jejuni in Czech Republic

Anotace:

Campylobacter jejuni je jednou z nejrozšřenějších bakterií, které jsou průvodcem alimentárních otrav. Již první zmínka o této bakterii byla publikována v roce 1886 Theodorem Escherichiem. Zástupci rodu byly dříve řazeny do rodu Vibrio. Až v roce 1973 byla vypracována komplexní taxonomie rodu Campylobacter a definovali se 4 nejdůležitější druhy: C. fetus, C. coli, C. jejuni a C. sputorum Zástupci rodu Campylobacter jsou charakterizováni jako gramnegativní, mikroaerofilní, malé zakřivené až spirálkovitě zahnuté tyčinky s typickým vývrtkovitým pohybem, pomocí polárně umístěných bičíků. Campylobacter vyžaduje v atmosféře přítomnost 3 5 % O2 a 3 10 % CO2. Je citlivý zejména k vyšší přítomnosti kyslíku a v aerobní atmosféře rychle hyne. Hlavním rezervoárem Campylobacter spp. je zažívací trakt hospodářských zvířat (C. jejuni a C. coli), domácích mazlíčků (C. upsaliensis), ptáků (u racků C. lari) i člověka. Je součástí střevní mikroflóry, odkud se dostává do prostředí porážek. Metabolismus rodu Campylobacter je respiratorního typu. Všechny druhy mají pozotivní oxidázovou a katalasovou reakci. To se dále velmi dobře využívá k samotné diagnostice. Rozlišuje se dohromady okolo 175 serotypů. Bakterie kolonizuje střevo pomocí chemotaxe. Pokud přežije, produkuje toxiny. Hlavním toxine Campylobacter spp. Je CDT (cytolethal distending toxin). Další toxiny produkované Campylobacter spp. jsou: enterotoxin podobný choleře, Shiga toxiny a hepatotoxin. Mezi nejčastější onemocnění patří gastroenteritida a kampylobakteriózy. Závažnou komplikací tohoto onemocnění je Guillain-Barré syndrom. Nejčastějším projevem je ale, lehký nebo střední vodnatý průjem. Léčba spočívá převážně v dehydrataci a podávání solných roztoků s glukózou. Jen v nejhorších případech jsou nasazovány antibiotika na bázi makrolidů nebo chinolonů. Ke kultivaci se používá nejčastěji CSM agar. Jako základní diagnostická metoda stále zůstává mikroskopie, ale provádí se široká škála metod jako biochemické, genetické, imunochemické, chemotaxonomické profilování mastných kyselin, metody gelové elektroforézy a měření molekulové hmotnosti druhově specifických proteinových biomarkerů hmotnostní spektrometrií MALDI-TOF. Tématem této práce bylo zjištění výskytu a porovnání způsobů diagnostiky na pracovišti mikrobiologické laboratoře Synlab czech s.r.o. Dále pak kultivace a stanovení citlivosti k antibiotikům. Na pracovišti na pracovišti mikrobiologické laboratoře Synlab czech s.r.o. se diagnóza určuje ze vzorku stolice, která je zasílána především od praktických dětských doktorů. K diagnostice se zde používá mikroskopie a hmotnostní spektrometrie MALDI-TOF. V roce 2012 bylo zachyceno 287 pozitivních nálezu infekce Campylobacter jejuni. Z celkového počtu bylo 54 % mužů a 46 % žen. V roce 2013 jich bylo pozitivních nálezů 251, z toho bylo 59 % mužů a 41 % žen. Nejčastější záchyt byl v měsících červen, srpen a září v obou rocích. Nejvíce náchylnou skupinou jsou děti a mladiství. V roce 2013 až 74 % pacientů z této věkové skupiny. U 206 kmenů Campylobacter jejuni byla stanovena citlivost k vybraným antibiotikům. 59 % kmenů bylo rezistentních k ampicilinu, 34 % kmenů k tetracyklinu, 35 % k erythromycinu a 71 % k oflaxicilinu.

Abstract:

Campylobacter jejuni is one of the most spreaded bacteria that causes food poisoning . The very first mention of this bacterium was published in 1886 by Theodore Escherichia. Members of the genus were formerly classified in the genus Vibrio. Taxonomy of the genus Campylobacter was developer in 1973 and four most important species were defined: C. fetus , C. coli , C. jejuni and C. sputorum Members of the genus Campylobacter are characterized as Gram-negative, microaerophilic , curved or spiral small curved rods with a typical motion that is caused by polar located flagella. Campylobacter requires the presence of 3-5 % O2 and 3-10 % CO2 . It is particularly sensitive to high presence of oxygen in an aerobic atmosphere and quickly dies. The main reservoir of Campylobacter spp. is the digestive tract of animals (C. jejuni and C. coli), pets (C. upsaliensis), birds ( seagulls at C. lari) and humans. It is part of the intestinal microflora, from where it enters the environment defeats. Metabolism of the genus Campylobacter is a bacterial respiratory type. All species have positive oxidase and catalase reaction. It can be very well used for actual diagnosis. Around 175 serotypes are distinguished. Bacteria colonize the gut using chemotaxis. If it survives, it produces toxins. The main toxine of Campylobacter spp. is CDT ( cytolethal distending toxin). Other toxins produced by Campylobacter spp. are: similar to cholera enterotoxin, Shiga toxins and hepatotoxin. The most common diseases include gastroenteritis and Campylobacteriousis. A serious complication of the disease is Guillain-Barré syndrome. The most common manifestation is light or moderate diarrhea. Treatment consists mainly of dehydration and administration of saline solutions with glucose . Only in the worst cases, antibiotics are deployed based on macrolides or quinolones. For cultivation is preferably used CSM agar. Microscoping is still basic diagnostic method, but new methods are carried out such as biochemical, genetic, immunochemical, chemotaxonomic profiling fatty acids, methods of gel electrophoresis and measuring the molecular weight of the species-specific protein biomarkers by mass spectrometry MALDI-TOF . The topic of this work was to determine the incidence and comparison of diagnostic methods for the microbiological laboratory work Synlab Czech s.r.o. and furthermore, cultivation and susceptibility to antibiotics. The diagnosis in the workplace of microbiological laboratories Synlab Czech s.r.o. is determined from a stool sample, which is sent particularly from children practicing doctors. The diagnosis uses microscopy and MALDI- TOF . It was detected 287 positive findings of Campylobacter jejuni infection in 2012 of the total, 54 % of men and 46 % women. There were 251 positive findings , of which 59 % of men and 41 % women in 2013. The most common seizure was in the months of June, August and September in both years . The most vulnerable groups are children and adolescents . Up to 74% of patients in this age group in 2013. Sensitivity to selected antibiotics was determined for 206 strains of Campylobacter jejuni. 59 % of the strains were resistant to ampicillin , 34 % of the strains to tetracycline , 35 % to erythromycin and 71 % to oflaxicilin.

Klíčová slova

Campylobacter jejuni, mikroaerofilní bakterie, CDT toxin, Guillain-Barré syndrom, CSM agar, hmotnostní spektrometrie MALDI-TOF

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 5. 5. 2014

Zveřejnit od: 5. 5. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: MUDr. Radim Kramář, CSc.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Zdravotně sociální fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Specializace ve zdravotnictví / Zdravotní laborant