Analýza repetic v genomech vybraných druhů modrásků rodů \kur{Polyommatus} a \kur{Lysandra}

Monika HRUBÁ

Bakalářská práce

Anotace:

Tato bakalářská práce se zabývá studiem mobilních elementů, které by mohly mít vliv na fragmentaci karyotypu u řádů Polyommatus a Lysandra (Lepidoptera). Přítomnost vybraných repetic v genomech 15 vybraných druhů modrásků byla testována metodou PCR. Stejná metoda byla také použita k detekci studovaných elementů u 13 vybraných druhů mravenců, protože mezi mravenci a myrmekofilními modrásky by mohlo docházet k horizontálnímu přenosu genů. Vybrané mobilní elementy byly lokalizovány na pachytenních jádrech pomocí fluorescenční in situ hybridizace. Výsledky této práce naznačují mozaikovitou distribuci repetic v rámci fylogenetických vztahů zkoumaných modrásků, která by mohla být částečně vysvětlena šířením mobilních elementů mezidruhovým křížením a horizontálním přenosem mezi studovanými rody Polyommatus a Lysandra.

Abstract:

This thesis focuses on the analysis of mobile elements in the genera Polyommatus and Lysandra (Lepidoptera) with a potential impact on karyotype fragmentation. The presence of selected mobile elements in genomes of 15 lycaenid species was tested by PCR. Moreover, the same method was used to detect these elements in 13 selected ant species, which may present a source for lateral gene transfer in myrmecophilous blue butterfly species. Selected transposable elements were localized in pachytene nuclei using fluorescence in situ hybridization. The results of this thesis suggest a patchy phylogenetic pattern of studied repeats which can be partly explained by mobile elements spread through interspecific hybridization and horizontal gene transfer among studied Polyommatus and Lysandra species.

Klíčová slova

mobilní elementy, transpozony, modrásci, Lepidoptera, Lycaenidae, Polyommatus, Lysandra, horizontální přenos genů, mezidruhové křížení, fragmentace karyotypu, PCR, qPCR, FISH

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 22. 5. 2020

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Martina Dalíková, Ph.D.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biologie / Biologie