Multiple sequence alignment pomocí dynamického programování – Martin Rusek
Martin Rusek
Master's thesis
Multiple sequence alignment pomocí dynamického programování
Multiple Sequence Alignment by Dynamic Programming
Abstract:
Zarovnávání sekvencí je oblast analýzy dat, která se často využívá k určení podobnosti vybraných dat a k jejich klasifikaci. Tato práce se tedy zabývá problematikou zarovnávání sekvencí s důrazem na metody využívající dynamické programování, a které umožňují zarovnávat více sekvencí najednou. Konkrétně to jsou metody Dynamic Time Warping, Longest Common Subsequence a jejich vícenásobné varianty. Jednotlivé …moreAbstract:
Alignment of sequences is an area of data analysis, which is often used to determine the similarity of the selected data and their classification. This work therefore deals with the issue of sequence alignment emphasizing methods which use dynamic programming, and which allow simultaneous multiple sequence alignment. Specifically, these methods are Dynamic Time Warping, Longest Common Subsequence and …more
Language used: Czech
Date on which the thesis was submitted / produced: 29. 4. 2016
Identifier:
http://hdl.handle.net/10084/115801
Thesis defence
- Date of defence: 7. 6. 2016
- Supervisor: Kateřina Slaninová
- Reader: Robert Skopal
Citation record
ISO 690-compliant citation record:
RUSEK, Martin. \textit{Multiple sequence alignment pomocí dynamického programování}. Online. Master's thesis. Ostrava: VŠB - Technical University of Ostrava, Fakulta elektrotechniky a informatiky. 2016. Available from: https://theses.cz/id/n4hul1/.
Full text of thesis
Accessibility: Plné texty vysokoškolských kvalifikačních prací obhájených na Vysoké škole báňské - Technické univerzitě Ostrava jsou uloženy v repozitáři DSpace. Přístup k plným textům mají všichni uživatelé bez omezení. Přístup je omezen pouze ve výjimečných případech, zpravidla z důvodu ochrany duševního vlastnictví. Nepřístupné práce jsou označeny jako closedAccess nebo embargoedAccess. Tištěné verze prácí jsou uloženy v Ústřední knihovně VŠB-TUO a jsou prezenčně přístupné ve studovně diplomových prací. Další nakládání s prací (kopírování, opisy, MVS) se řídí Knihovní a výpůjčním řádem Ústřední knihovny VŠB-TUO.
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- autentizovaným zaměstnancům ze stejné školy/fakulty
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: VŠB - Technická univerzita OstravaVŠB - Technical University of Ostrava
Fakulta elektrotechniky a informatikyMaster programme / field:
Informační a komunikační technologie / Informatika a výpočetní technika
Theses on a related topic
-
Metody vícenásobného zarovnávání nukleotidových sekvencí
Ondřej Trněný -
Effects of hyperparameters in multiple sequence alignment for Align-RUDDER using Clustal
Christian SAMWALD -
Influence of Clustal W hyperparameters in multiple sequences alignment for AlignRUDDER
Marlene GANZ -
Advanced Dependency Alignment for a Build System
Ján Michalov -
Influence of Clustal W hyperparameters in multiple sequences alignment for AlignRUDDER
Marlene GANZ -
Effects of hyperparameters in multiple sequence alignment for Align-RUDDER using Clustal
Christian SAMWALD -
Business process creation for Discopus company and alignment of those processes with Information Technology.
Denis Karateev -
IT Management Culture and Strategic Alignment in the Era of Digitalization
Marcel Roland Sieber