Nová generace sekvenování – její principy a využití v mikrobiologii

Mgr. Ievgeniia Skrypnykova

Bachelor's thesis

Next-generation sequencing – principles and applications in microbiology

Abstract:

V současné době sekvenování DNA patří mezi standardní molekulárně-biologické metody používané v laboratorní praxi. Znalost sekvence DNA se uplatňuje jak v základním, tak i v aplikovaném výzkumu. Tato bakalářská práce je zaměřena na popis jednotlivých metod nové generace sekvenování (NGS) a třetí generace sekvenování (TGS) a jejich srovnání s klasickými metodami (Maxam-Gilbertova a Sangerova metody). Tato práce rovněž obsahuje stručný přehled o bioinformatickém zpracování dat získaných pomocí sekvenačních metod a o možnostech praktického využití sekvenování DNA s důrazem na oblast mikrobiologie.

Abstract:

Nowadays DNA sequencing belongs to standart molecular biology methods used in laboratories. Knowledge of DNA sequence finds its use in both general and applied science. This bachelor’s thesis is focused on describing principles of individual new generation sequencing (NGS) and third generation sequencing (TGS) methods and comparing them to classical sequencing methods (Maxam-Gilbert and Sanger methods). This thesis also includes brief overview of sequencing data analysis using bioinformatics tools and possibilities of practical application of DNA sequencing with emphasis on the field of microbiology.

Keywords

sekvenování DNA, sekvenační metody, nová generace sekvenování, NGS, třetí generace sekvenování, TGS, využití sekvenování, DNA sequencing, sequencing methods, next-generation sequencing, third generation sequencing, sequencing application

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 6. 5. 2015

Thesis defence

• Date of defence: 2. 6. 2015
• Supervisor: doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Experimental Biology / Special Biology