Využití kapilární elektroforézy v metabolomice

Bc. Jindra Musilová, Ph.D.

Master's thesis

Abstract:

Metabolomika, která muže být definována jako stanovení hladiny všech nebo vybraných metabolitu v daném organismu za daného metabolického stavu, se stala duležitou pomuckou pro objasnení bunecných procesu. Pedstavuje tak komplementární vedecký prístup vzhledem ke genomickým i proteomickým studiím príslušných organismu. Metabolomická analýza navíc muže prinést duležité praktické informace o metabolických poruchách spojených s chorobnými procesy, diagnostických márkrech, metabolismu léciv a jejich farmakokinetice. Díky výhodám CE, oproti jiným technikám, jako je možná automatizace, rychlost analýzy, malá spotreba vzorku a minimální organické odpady, nachází CE uplatnení i v metabolomických studiích. Prestože jistým problémem muže být nízká koncentracní citlivost, CE skýtá celou radu možností pro eliminaci tohoto problému, jako je napr. využití on-line pre-koncentracních technik.

Abstract:

Metabolome analysis is the systematic chemical analysis of metabolites presented in a cell, which may be used to investigate the metabolic activity in the cell as important addition to extensive studies of DNA sequences {genome} and proteins {pro-teome}. A method capillary electrophoresis (CE) is one of the most promising techniques for the metabolome analysis, because it gives high-resolution separations in a reason-able time and requires a minimum amount of samples. On-line precocentration techniques field enhanced stacking, sweeping, dynamic pH junction - can be used to enhance concentration sensitivity when using UV detection.

Keywords

kapilární elektroforéza, metabolomika, prekoncentraní techniky, sweeping, field enhanced stacking, dynamic pH junction, pre-koncentrace, zaostení, bakterie P. denitrificans, Paracoccus denitrificans, metabolit, metabolický stav, CE, CZE, metabolomické studie, metabolome analysis, capillary electrophoresis, preconcentration techniques, UV detection, UV detekce

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 28. 4. 2006

Thesis defence

• Date of defence: 24. 5. 2006
• Supervisor: prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Biochemistry / Biochemistry