Rezistence Escherichia coli na vybraná antibiotika v okrese Písek za rok 2016

Karolína BROMOVÁ

Bachelor's thesis

Resistances of Escherichia coli to selected antibiotics in a district of Písek for the year 2016

Abstract:

Rezistence na antibiotika se stává celosvětovým problémem. Ve své práci jsem se zaměřila na rezistence Escherichia coli v okrese Písek v roce 2016. Escherichia coli je nejčastějším původcem infekcí močových cest. V průměru každá druhá žena a každý pátý muž prodělají infekci močových cest. S problémy rezistence se setkáváme už řadu let. Dříve účinná antibiotika jsou dnes neúčinná. Často se musí sahat po širokospektrálních antibiotikách, která mají řadu vedlejších účinků (průjmy, kvasinkové infekce), jsou dražší a mají dopad na ekonomiku. V ČR zatím nemáme takovou míru rezistence jako v jiných státech např. v Řecku. Proto bychom si měli vzít příklad z ostatních zemí a vyvarovat se masivnímu užívání antibiotik. Cílem mé práce bylo nashromáždit informace o rezistenci Escherichia coli, porovnat rozdíly mezi dospělými a dětskými pacienty a zjistit míru ESBL kmenů v okrese Písek v roce 2016. Výsledky svého výzkumu porovnám s výsledky močové studie NRL SZÚ v Praze za rok 2016. V teoretické části jsem se zabývala především charakteristikou antibiotik, způsoby antibiotické rezistence a stručným popisem Escherichia coli. Ve své praktické části jsem popsala způsoby identifikace bakterií (ENTERO test 24N). Principy biochemických testů (VP test, INDOL test), které nám pomohou blíže určit, o jaký typ bakterie by se mohlo jednat. Dále popisuji principy a využití testů pro stanovení citlivosti (Diskový difuzní test, Mikrodiluční test M.I.C.). Pomocí ESLB MAST testu jsem zjistila v jaké míře se vyskytovali v okrese Písek kmeny produkující ESBL beta-laktamázu s rozšířeným spektrem účinku, které způsobují multirezistenci. Dále praktická část obsahuje vyhodnocení statistiky o rezistenci na vybraná antibiotika, kterou jsem zpracovávala z dat klinické mikrobiologie Nemocnice Písek a.s. Ke svému pozorování rezistence Escherichia coli jsem si vybrala 4 druhy antibiotik, používaných při léčbě infekcí močových cest Amoxicilin, amoxicilin + klavulanát, nitrofurantoin a gentamicin. Výsledky mé práce dokazují, že rezistence na vybraná antibiotika je poměrně vysoká. Vyplívá, že ženy mají více rezistentních kmenů než muži, což by se dalo vysvětlit tím, že ženy trpí častěji močovými infekcemi a vyskytuje se u nich více ESBL kmenů. U dětských a mladistvých pacientů (0 19 let) se nevyskytují žádné ESBL kmeny. Dále vyplývá, že i dívky trpí častěji močovými infekcemi než chlapci, kdy jediná výjimka je u dívek a chlapců ve věku 0 3 roky kdy podle mého výzkumu močovými infekcemi trpí více chlapci než dívky.

Abstract:

Resistance to antibiotics is becoming a global problem. In my work I focused on the resistance of Escherichia coli in the Písek district in 2016. Escherichia coli is the most common cause of urinary tract infections. On average, every second woman and every fifth male will experience urinary tract infection. Resistance problems have met for many years. Previously effective antibiotics are now ineffective. Often they have to go beyond wide-spectrum antibiotics that have a number of side effects (diarrhea, yeast infections), are more expensive and have an impact on the economy. In the Czech Republic, we do not yet have the same level of resistance as in other countries, In Greece. Therefore, we should take an example from other countries and avoid massive use of antibiotics. The objectives of my work were to collect information on Escherichia coli resistance, to compare the differences between adult and pediatric patients and to determine the degree of ESBL strains in the Písek district in 2016. I compare the results of my research with the results of the urinalysis study of NRL SZÚ in Prague for 2016. In the theoretical part, I have dealt mainly with antibiotic characteristics, antibiotic resistance methods and briefly describe Escherichia coli. In its practical part, methods of identifying bacteria (ENTERO test 24N) are described. Principles of biochemical tests (VP test, INDOL test) to help us determine what type of bacteria might be. I also describe the principles and use of sensitivity assays (Disk diffusion test, M.I.C. microdilution test). Using the ESLB MAST test, I discovered the extent to which ESBL beta-lactamase-producing strains with extended spectrum of effect, which cause multi-resistance, were found in the Písek district. Furthermore, the practical part contains evaluation of resistance statistics on selected antibiotics, which I processed from data from the clinical microbiology of Písek Hospital. For my observation of Escherichia coli resistance, I chose 5 types of antibiotics used in the treatment of urinary tract infections - Amoxicillin, amoxicillin + clavulanate, nitrofurantoin, cefotaxim, and gentamicin. The results of my work demonstrate that resistance to selected antibiotics is relatively high. It appears that women have more resistant strains than men, which can be explained by the fact that women are more likely to have urinary infections and more ESBL strains are present. No ESBL strains are present in pediatric patients (0 - 19 years). It also follows that girls are more likely to suffer from urinary infections than boys, with the only exception being girls and boys aged 0-3 years old, according to my research with urinary infections suffer more boys than girls.

Keywords

Antibiotika, rezistence, Escherichia coli, citlivost, Enterobacteriaceae, ESBL kmeny, multirezistence

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 2. 8. 2018

Thesis defence

• Supervisor: MUDr. Věra Kůrková

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Sciences

Bachelor programme / field:
Specialization in Health Service / Health Technician