Změny hladin transkriptů obranných genů rostlin Lycopersicum esculentum v odpovědi na napadení patogenem

Mgr. Martina Pečinková

Bakalářská práce

The changes in defense genes transcripts levels of plants Lycopersicum esculentum to pathogen attack

Anotace:

Pokud je rostlina napadena patogenem a patogen je rostlinou rozpoznán, dochází k tzv. nekompatibilní interakci rostliny s patogenem, kdy dochází k aktivaci obranných mechanizmů rostliny. Vlastní obranná reakce zahrnuje celou řadu dějů, mezi něž patří např. přestavba buněčné stěny, produkce fytoalexinů a zejména exprese obranných (PR) proteinů. Práce se soustředí na sledování změn koncentrace transkriptů vybraných PR-proteinů u rostliny Lycopersicum esculentum, přesněji u dvou kultivarů této rostliny (cv. Amateur a cv. Chmielewskii), které vykazují při napadení patogenem různou náchylnost k infekci. Sledovány byly geny, které kódují PR proteiny chi27, glu, P4, cevi-1, apx, rboh1 a pal6. Měření potvrdila očekávané trendy změn koncentrace transkriptů genů. U apx byla potvrzena inhibice na post-translační úrovni. U chi27 byly u každého kultivaru pozorovány jiné trendy, které nasvědčují tomu, že u kultivaru Amateur došlo k nekompatibilní interakci s patogenem Oidium neolypersici, zatímco kultivar Chmielewskii vykazoval interakci kompatibilní.

Abstract:

If the plant is attacked by a pathogen and the pathogen is recognized by the plant, there is the incompatible interaction between plant and pathogen, which leads to activation of defense mechanisms of plant. The defense reaction involves a number of processes, which include reconstruction of the cell wall, production of fytoalexins and particularly expression of patogenesis-related (PR) proteins. The work focuses on monitoring changes in concentrations of transcripts of selected PR-proteins of plant Lycopersicum esculentum, specifically of two cultivars of this plant (cv. Amateur and cv. Chmielewskii), which show a different susceptibility to infection during the attack of pathogen. The genes that encode PR proteins chi27, glu, P4, cevi-1, APX, rboh1 and pal6 were measured. Measurements confirmed the expected trends of changes in transcript levels of genes. The inhibition of post-translational apx level was confirmed. Each cultivar showed different trends of chi27 that suggest that the Amateur cultivar was in incompatible interaction with pathogen Oidium neolypersici while Chmielewskii cultivar displayed a compatible interaction.

Klíčová slova

qPCR, PR proteiny, Lycopersicum esculentum, PR proteins

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 14. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 19. 6. 2012
• Vedoucí: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Chemoinformatika a bioinformatika