Anotace elementů sekundární struktury proteinů – Mgr. Adam Midlik
Mgr. Adam Midlik
Master's thesis
Anotace elementů sekundární struktury proteinů
Annotation of secondary structure elements in proteins
Abstract:
Studium struktur proteinů v rámci proteinové rodiny vyžaduje konzistentní pojmenování elementů sekundární struktury (SSE) vyskytujících se v těchto strukturách. Tradičně musí být SSE anotovány ručně. V této práci byla navržena metoda automatické anotace, která pak byla (jako program SecStrAnnotator) implementována v jazyce C#. Algoritmus sestává ze tří kroků: superimpozice (přiložení) dotazovaného …moreAbstract:
Study of structures of proteins within a protein family requires consistent naming of the secondary structure elements (SSEs) occurring in these structures. Traditionally, the SSEs have to be annotated manually. In this work an automated method for SSE annotation was designed and afterwards implemented (as a program SecStrAnnotator) in language C#. The algorithm consists of three steps: superimposition …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 4. 1. 2017
Identifier:
https://is.muni.cz/th/jqrog/
Thesis defence
- Date of defence: 7. 2. 2017
- Supervisor: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.
- Reader: RNDr. Tomáš Raček
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Applied Informatics / Applied Informatics
Theses on a related topic
-
Anotace a vizualizace sekundární struktury proteinů
Adam Midlik -
Anomální struktury DNA v lidském genomu
Helena Kašparová -
The visualization of secondary structure elements of proteins in 2D
Ivana Hutařová Vařeková -
The visualization of secondary structure elements of proteins in 2D
Ivana Hutařová Vařeková -
Strukturní bioinformatika G-kvadruplex vazebných proteinů a jejich interakcí s nekanonickými formami nukleových kyselin
Jiří MARZOLL -
Structural dynamics of naked and nucleosomal DNA containing a radiation lesion
Eva Matoušková -
Context-dependent structural properties of methylated and unmethylated DNA
Martina Zoubková -
Sequence dependent structural dynamics of DNA containing radiation damage
Oleksandra Shumilina