Stanovení mutací u vybraných hematologických chorob pomocí metody MassArray

Bc. Nikola HLAWICZKOVÁ

Master's thesis

Detection of mutations in selected hematological diseases using the MassArray method

Abstract:

Předložená diplomová práce s názvem "Stanovení mutací u vybraných hematologických chorob pomocí metody MassArray" se věnuje detekci mutací v oblasti kinázové domény fúzního genu BCR-ABL1 u pacientů s chronickou myeloidní leukémií, kteří byli léčeni a sledováni na Hemato-onkologické klinice Fakultní nemocnice a Lékařské fakulty Univerzity Palackého v Olomouci. Teoretická část práce shrnuje základní poznatky a informace o chronické myeloidní leukémii, její molekulární podstatu a diagnostiku. Další kapitoly jsou věnované léčbě této nemoci, rozvoji rezistence na podávanou léčbu a detekci mutací v oblasti kinázové domény fúzního genu BCR-ABL1, které tuto rezistenci mohou zapříčiňovat. Experimentální část se zaměřuje na stanovení mutací v oblasti kinázové domény fúzního genu BCR-ABL1. Celkem bylo vyšetřeno 25 pacientů s CML se zvyšující se hladinou transkriptu BCR-ABL1, která značí snižující se biologickou odpověď na podávanou léčbu. Výchozím materiálem byla periferní krev nebo kostní dřeň pacientů, ze které byla izolována RNA, která se reverzní transkripcí přepsala do komplementární cDNA. Získaná cDNA byla vyšetřena vybranými molekulárně genetickými metodami, které potvrdily přítomnost nebo nepřítomnost mutace v kinázové doméně BCR-ABL1.

Abstract:

The presented diploma thesis entitled "Detection of mutations in selected hematological diseases using the MassArray method" is dedicated to detection of BCR-ABL1 kinase domain mutations in patients with chronic myeloid leukemia examined and treated at Hemato Oncology Clinic of Faculty Hospital in Olomouc. The theoretical part summarizes a basic knowledge and information about chronic myeloid leukemia, its molecular basis and diagnostics. Next chapters are dedicated to treatment of this disease, development of drug resistance and detection of BCR-ABL1 kinase domain mutations cause the resistance. The practical part focuses on determination of mutations in kinase domain of BCR ABL1 fusion gene. A total of 25 patients with CML with increasing BCR-ABL1 transcript levels were examined. RNA was isolated from peripheral blood or bone marrow from CML patients and used for selected molecular genetic analysis that confirmed presence or absence of mutations in kinase domain of BCR-ABL1.

Keywords

chronická myeloidní leukémie, CML, mutace, tyrosin kinázová doména, BCR ABL1, rezistence, tyrosin kinázový inhibitor, MassArray, Sangerovo sekvenování

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 24. 7. 2020

Thesis defence

• Supervisor: RNDr. Martina Divoká, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / field:
Biology / Molecular and Cell Biology