Porovnání detekce tvorby biofilmu u klinických kmenů Staphylococcus aureus z ran pomocí kultivačních a genetických metod.

Bc. Tereza VÁLKOVÁ

Bachelor's thesis

Comparison of detection of biofilm formation in clinical strains of Staphylococcus aureus from wounds using culture and genetic methods.

Abstract:

Hlavním tématem této bakalářské práce je bakterie Staphylococcus aureus, její schopnost tvorby biofilmu a diagnostiky tohoto vytvořeného biofilmu. Teoretická část práce se nejprve zaměřuje na samotnou bakterii, její morfologii, antigenní stavbu a faktory virulence. Dále bude popsána její patogeneze a patogenita, včetně problematiky meticilin rezistentních kmenů Staphylococcus aureus. Další část se pak zaměřuje na biofilm. Bude popsáno složení, struktura a tvorba biofilmu. Dále pak jeho role v patogenitě, možnostech léčby a různé způsoby detekce. Praktická část popisuje způsoby detekce biofilmu. První metodou je barvení krystalovou violetí dle Christensena. Tato metoda vyšla pozitivní pro všech 94 zkoumaných kmenů Staphylococcus aureus. A dále bylo provedeno rozřazení těchto kmenů do kategorií podle míry produkce biofilmu. Druhou metodou bylo Real-time PCR a detekce vybraných genů, zodpovědných za tvorbu biofilmu: clfA, fnbA a fnbB. U 93 vzorků byly nalezeny 2 až 3 geny, pouze u jednoho vzorku nebyl detekován ani jeden z vybraných genů. Bylo tedy prokázáno, že všechny kmeny jsou schopny v různé míře tvorby biofilmu a neprokázala se souvislost mezi přítomností zkoumaných genů a mírou produkce biofilmu.

Abstract:

The main topic of this bachelor thesis is the bacterium Staphylococcus aureus, its ability to form a biofilm and the diagnostics of this formed biofilm. The theoretical part of the thesis first focuses on the bacterium itself, its morphology, antigenic structure and virulence factors. Furthermore, its pathogenesis and pathogenicity will be described, including the issue of the methicillin-resistant Staphylococcus aureus. The next part focuses on the biofilm. The composition, structure and formation of biofilm will be described, as well as its role in pathogenicity, treatment options and various methods of detection. The practical part describes methods of biofilm detection. The first method is crystal violet staining according to Christensen. This method came out positive for all 94 tested strains of Staphylococcus aureus. Subsequently, these strains were divided into categories according to the strength of biofilm production. The second method was Real-time PCR and the detection of selected genes responsible for biofilm formation: clfA, fnbA and fnbB. 2-3 genes were found in 93 samples, and only one sample contained none of the selected genes. Thus, it was shown that all strains are capable of biofilm formation to varying degrees, and no correlation was found between the presence of the examined genes and the level of biofilm production.

Keywords

Staphylococcus aureus, biofilm, Christensenova metoda, Real-time PCR, gen

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 29. 4. 2024

Thesis defence

• Supervisor: Mgr. Lukáš VACEK

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Health and Social Sciences

Bachelor programme / field:
Laboratory Diagnostics / Laboratory Diagnostics