Genetická manipulace u patogenních spirochet

Bc. Anežka Niesnerová

Bachelor's thesis

Genetic manipulation of pathogenic spirochetes

Anotácia:

Patogenní spirochety jsou bakterie citlivé k faktorům vnějšího prostředí bez možnosti kultivace. Zároveň toho není příliš známo o jejich přirozeném přenosu genů. Tyto faktory znesnadňují práci s nimi a především jejich mutagenezi. Přesto byly v posledních letech vytvořeny metody, které práci s těmito bakteriemi umožňují. Zpočátku byly tyto metody založené na komplementaci narušených genů v Escherichia coli, poté se již začala mutageneze provádět v samotných spirochetách. Pomocí plazmidů byly geny spirochet inaktivovány nebo byly do jejich genomu vkládány geny nové či upravené. Podařilo se docílit náhodné i cílené mutageneze a u některých také transdukce bakteriofágem. Pouze některé spirochety mají vlastní plazmidy nebo bakteriofágy, proto byly často používány plazmidy nebo fágy se širokým rozmezím hostitelů. Doposud nebyla geneticky modifikována Treponema pallidum. Pro ni by však mohly být použitelné metody aplikované u ostatních spirochet, které jsou zmíněny v závěru práce.

Abstract:

Pathogenic spirochetes are bacteria sensitive to environmental factors without possibility of cultivation. Simultaneously there is not much known about their natural gene transfer. These factors complicate working with them and especially their mutagenesis. In the last few years there were created methods which make work with these bacteria possible. At the beginning these methods were based on complementation of disrupted genes in Escherichia coli, later mutagenesis was made in very spirochetes. Genes of spirochetes were inactivated with help of plasmids or new or changed genes were transferred into their genome. Random and targeted mutagenesis were achieved and for some also bacteriophage transduction. Only some spirochetes have their own plasmids or bacteriophages, therefore broad-host range plasmids or phages were frequently used. Treponema pallidum wasn´t cultivated so far. Methods applied for the other spirochetes, mentioned in the end of work, could be used for mutagenesis of it.

Kľúčové slová

spirochety, genetická manipulace, Treponema pallidum, spirochetes, genetic manipulation

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 4. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 9. 6. 2016
• Vedúci: prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biology / Medical Genetics and Molecular Diagnostics