Interakce proteinu IFI16 s DNA a proteiny.

Ondřej KWAŠNÝ

Bachelor's thesis

Interaction of IFI16 protein with DNAs and proteins.

Anotácia:

Protein IFI16 je zástupcem rodiny HIN-200, která zahrnuje šest myších (p202a, p202b, p203, p204, p205, p206) a čtyři lidské (IFI16, AIM2, MNDA, IFIX) proteiny. Společným znakem této rodiny je 200 aminokyselinový motiv, který se nachází na C-konci všech zástupců a je označován jako HIN doména. Na N-konci se pak nachází PAAD/DAPIN/PYRIN doména. IFI16 je schopen vazby DNA a může interagovat s proteiny jako p53, BRCA1, pRb a dalšími. V této práci se zabývám strukturou proteinu IFI16, jeho interakcemi s DNA a proteiny p53 a BRCA1.

Abstract:

Protein IFI16 is a member of HIN-200 family, which consists of six murine (p202a, p202b, p203, p204, p205, p206) and four human (IFI16, AIM2, MNDA, IFIX) proteins. Common feature of this family is 200 amino acids repeat, which is located at the C-terminus of all members and is called HIN domain. At the N-terminus is located PAAD/DAPIN/PYRIN domain. IFI16 is able to bind DNA and it can interact with protein p53, BRCA1, pRb and others. In this work I write about structure of IFI16 protein, its interactions with DNAs and proteins p53 and BRCA1.

Kľúčové slová

IFI16, rodina HIN-200, doména HIN-200, OB-fold doména, PAAD/DAPIN/PYRIN doména, vazba DNA, interakce, p53, BRCA1.

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 23. 4. 2014

Zverejniť od: 23. 4. 2014

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 19. 5. 2014
• Vedúci: RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.

University of Ostrava

Faculty of Science

Bachelor programme / odbor:
Biology / Experimental Biology