MUDr. Ladislav Špringel

Bakalářská práce

Program pro analýzu smíšených sekvenačních chromatogramů.

Computer program for analysis of mixed sequencing chromatograms.
Abstract:
Common problem of clinical samples sequencing are mixed chromatograms. Such chromatograms occur because of sequencing of polymicrobial samples. This problem can be sloved by labor-intensive laboratory approach or expensive computational approach by using commertial tool RipSeq Mixed. Result of this bachelor thesis is computer program 16S DeMixer designed according to the requirements of the Genetics …více
Abstract:
Výskyt zmiešaných sekvenačných chromatogramov je častým problémom pri sekvenovaní klinických vzoriek. Takéto chromatogramy vznikajú predovšetkým u typických polymikrobiálnych vzoriek, ako je napríklad sputum, bronchoalveolárna laváž či stery zo slizníc. Tento problém je riešiteľný laboratórne izolovaním jednotlivých kmeňov baktérií a opätovným sekvenovaním alebo pomocou komerčného nástroja RipSeq Mixed …více
 

Klíčová slova

Sangerovo sekvenovanie zmiešané sekvencie polymikrobiálne vzorky klinická mikrobiológia ribozomálna RNA 16S rRNA
 
Jazyk práce: slovenština
Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 29. 5. 2017
Identifikátor: https://is.muni.cz/th/nuov9/

Obhajoba závěrečné práce

  • Obhajoba proběhla 27. 6. 2017
  • Vedoucí: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
  • Oponent: Ing. Jiří Hon

Citační záznam

Citovat tuto práci

Plný text práce

Obsah online archivu závěrečné práce
Zveřejněno v Theses:
  • světu
Jak jinak získat přístup k textu
Instituce archivující a zpřístupňující práci: Masarykova univerzita, Fakulta informatiky
Složka Odkaz na adresář do lokálního úložiště instituce

Masarykova univerzita

Fakulta informatiky

Bakalářský studijní program / obor:
Aplikovaná informatika / Bioinformatika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
  • Žádné práce na příbuzné téma.