Program pro analýzu smíšených sekvenačních chromatogramů. – MUDr. Ladislav Špringel
MUDr. Ladislav Špringel
Bachelor's thesis
Program pro analýzu smíšených sekvenačních chromatogramů.
Computer program for analysis of mixed sequencing chromatograms.
Abstract:
Common problem of clinical samples sequencing are mixed chromatograms. Such chromatograms occur because of sequencing of polymicrobial samples. This problem can be sloved by labor-intensive laboratory approach or expensive computational approach by using commertial tool RipSeq Mixed. Result of this bachelor thesis is computer program 16S DeMixer designed according to the requirements of the Genetics …moreAbstract:
Výskyt zmiešaných sekvenačných chromatogramov je častým problémom pri sekvenovaní klinických vzoriek. Takéto chromatogramy vznikajú predovšetkým u typických polymikrobiálnych vzoriek, ako je napríklad sputum, bronchoalveolárna laváž či stery zo slizníc. Tento problém je riešiteľný laboratórne izolovaním jednotlivých kmeňov baktérií a opätovným sekvenovaním alebo pomocou komerčného nástroja RipSeq Mixed …more
Language used: Slovak
Date on which the thesis was submitted / produced: 29. 5. 2017
Identifier:
https://is.muni.cz/th/nuov9/
Thesis defence
- Date of defence: 27. 6. 2017
- Supervisor: Ing. Matej Lexa, Ph.D.
- Reader: Ing. Jiří Hon
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsBachelor programme / field:
Applied Informatics / Bioinformatics
Theses on a related topic
- No theses on a related topic available.