Studium interakce mutantních proteinů p53 s DNA.

Bc. Sarah SCHILLEROVÁ

Master's thesis

The study of mutant p53 proteins interactions with DNA.

Anotácia:

Protein p53 je jedním z nejvíce studovaných nádorových supresorů. Funguje jako transkripční faktor, který se sekvenčně specificky váže na promotory cílových genů a tím se podílí např. na zastavení buněčného cyklu a vyvolání apoptózy. Byla dokázána také strukturně specifická vazba proteinu na nekanonické struktury. V této práci se zabývám vazbou wtp53 a mutp53 R175H na sekvence s potenciálem tvořit kvadruplex nacházející se v promotorech genů c-MYC, ATF a BRIP1. K pozorování vazebných afinit obou konstruktů proteinu p53 k DNA byla zvolena metoda EMSA a metoda cirkulárního dichroismu. Z výsledků této práce vyplývá, že wtp53, ale také mutp53 R175H se váže na všechny 3 vybrané kvadruplexy a že metoda CD je také vhodná ke studiu vazebných vlastností proteinu na kvadruplexovou DNA.

Abstract:

Protein p53 is one of the most studied tumor suppressor genes. It works as a transcription factor that binds sequence specifically to the promoters of target genes and thus contributes e.g. on cell cycle arrest and induction of apoptosis. It was demonstrated that protein is binding structurally specific to a non-canonical structure. This thesis is about binding wtp53 and mutp53 R175H to sequences in several gene promotors that has potential to form a quadruplex which are in promotors of genes c-MYC, ATF and BRIP1. In order to observe the binding affinities of both constructs of the p53 protein to the DNA was chosen method EMSA and circular dichroism. The results of this thesis suggest that wtp53 but also mutp53 R175H binds all 3 selected quadruplexes and method CD is also suitable to study the binding properties of proteins to quadruplex DNA.

Kľúčové slová

Wtp53, mutp53 R175H, kvadruplex, DNA

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 24. 4. 2017

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 23. 5. 2017
• Vedúci: doc. RNDr. Petr Pečinka, Ph.D.

University of Ostrava

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Experimental Biology