Standardized data formats for electrophysiological data

Bc. Lukáš ŠČURKO

Master's thesis

Abstract:

This master's thesis describes standards for storing electrophysiological data in order to find a suitable standard for data conversion from the BrainVision standard, which is used in the neuroinformatics laboratory at the University of West Bohemia. The standards are examined from several points of view, on the basis of which the standard into which the existing data has been converted is selected. It was verified whether the standards meet the Fair principles. The complexity of data conversion and supporting libraries to the standards examined was also assessed. Furthermore, a tool is created that converts electrophysiological data from BrainVision standard to the selected standard. A suitable data storage was selected for the converted data, in which the data was stored.

Abstract:

Tato diplomová práce popisuje standardy pro ukládání elektrofyziologických dat za účelem najít vhodný standard pro převod dat z BrainVision standardu, který je používán v neuroinformatické laboratoři na Západočeské univerzitě. Standardy jsou prozkoumány z několika hledisek, na základě kterých je vybrán standard, do kterého se převedla stávající data. Bylo ověřováno, zda standardy splňují Fair principy. Byla také posuzována složitost převodu dat a podpůrných knihoven k prozkoumávaným standardům. Dále je vytvořen nástroj, který elektrofyziologická data z BrainVision standardu převede do vybraného standardu. Pro převedená data bylo zvoleno vhodné datové úložiště, do kterého se data uložila.

Keywords

elektrofyziologická data, fair principy, datové formáty, BIDS, konverzní nástroj

Language used: English

Date on which the thesis was submitted / produced: 20. 5. 2021

Accessible from:: 31. 12. 2999

Thesis defence

• Supervisor: Ing. Roman Mouček, Ph.D.

University of West Bohemia

Faculty of Applied Sciences

Master programme / field:
Computer Science and Engineering / Software Engineering