Zpět na vyhledávání

Marlene GANZ

Bachelor's thesis

Influence of Clustal W hyperparameters in multiple sequences alignment for AlignRUDDER

ClustalW, Multiple Sequence Alignment, Reinforcement learning, Influence of Clustal W hyperparameters in mutiple sequences alignment for AlignRUDDER
Abstract:
Reinforcement learning algorithms suffer from the delayed reward problem and usually only perform well when being trained with vast amounts of data. AlignRUDDER overcomes this problem by using a multiple sequence alignment for the initialization performed with ClustalW. In this thesis we work with different data­sets and AlignRUDDER to search for optimal align­ ment hyperparameters for reinforcement …more
Abstract:
Reinforcement learning algorithms suffer from the delayed reward problem and usually only perform well when being trained with vast amounts of data. AlignRUDDER overcomes this problem by using a multiple sequence alignment for the initialization performed with ClustalW. In this thesis we work with different data­sets and AlignRUDDER to search for optimal align­ ment hyperparameters for reinforcement …more
 

Keywords

ClustalW Reinforcement Learning AlignRUDDER Multiple Sequence Alignment Hyperparameter Search
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 17. 3. 2021

Thesis defence

  • Supervisor: prof. Dr. Sepp Hochreiter

Citation record

Cite this text
The right form of listing the thesis as a source quoted

GANZ, Marlene. Influence of Clustal W hyperparameters in multiple sequences alignment for AlignRUDDER. Č. Budějovice, 2021. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH, Přírodovědecká fakulta
http://wstag.jcu.cz/StagPortletsJSR168/CleanUrl?urlid=prohlizeni-prace-detail&praceIdno=64542 Reference to the local database file of the institution

UNIVERSITY OF SOUTH BOHEMIA IN ČESKÉ BUDĚJOVICE

Faculty of Science

Bachelor programme / field:
Applied Informatics / Bioinformatics

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.
 
Name
Posted by
Uploaded/Created
Rights
Theses o65zkh o65zkh/2
17/3/2021
Folders
Files
thesis Bachelor_Thesis_MarleneGanz.pdf
Bulánová, L.
18/3/2021

  • Co je jinak přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Co je jinak další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Co je jinak pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Co je nové vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Co je nové rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.

  • Co se chystá

    Připravujeme další vylepšení pro mobilní zařízení.