Genomická a fenotypová heterogenita bakteriálních kmenů Acidithiobacillus

Mgr. Věra Petrišáková

Bakalářská práce

Genomic and phenotypic heterogeneity of Acidithiobacillus spp. strains

Anotace:

Teoretická část této bakalářské práce je zaměřena na acidofilní bakterii Acidithiobacillus ferrooxidans a biohydrometalurgické procesy. Dále shrnuje současné možnosti identifikace mikroorganismů s použitím kultivačních a DNA molekulárních technik. Molekulární metody jsou zaměřeny jak na analýzu DNA celé komunity, tak hlavně na analýzu DNA částečné komunity. V praktické části byly některé tyto metody vyzkoušeny. Byly provedeny přímé kultivace divokých acidofilních kmenů ze sulfidického odpadu po důlní těžbě ve Zlatých horách. Dále pak byla testována přímá izolace DNA z těchto odpadů s následnou polymerázovou řetězovou reakcí a detekcí 16S rRNA produktů na gelu.

Abstract:

Theoretical part of this thesis is focused on acidophilic bacteria Acidithiobacillus ferrooxidans and biohydrometallurgical processes. Furthermore, it summarizes current possibilities of the identification of microorganisms using the culture and DNA molecular techniques. Molecular techniques are focused on whole genomic community DNA analysis, and especially partial community DNA analysis. In practical part, some of those methods were tested. Direct cultivations of wild-type acidophilic strains from sulfide wastes after mining in the Yellow Mountains were performed. Moreover a direct DNA isolation from these wastes was tested, followed by polymerase chain reaction and detection of the products of 16S rRNA on the gel.

Klíčová slova

Acidithiobacillus ferrooxidans, \bioloužení, \DNA analýza, \identifikace mikroorganismů, bioleaching, DNA analysis, identification of microorganisms

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 18. 5. 2015

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 19. 6. 2015
• Vedoucí: Mgr. Jiří Kučera, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie