Komparativní karyotypizace okruhu plicníku měkkého (Pulmonaria mollis agg.)

Šarlota TRABALÍKOVÁ

Bakalářská práce

Comparative karyotype analysis in Pulmonaria molis group

Anotace:

Tato cytogenetická studie se zaměřuje na skupinu Pulmonaria mollis, která představuje evolučně zajímavý model díky výrazné genomové různorodosti a časté hybridizaci mezi jednotlivými druhy. Ke zkoumání chromozomální organizace byla využita metoda fluorescenční in situ hybridizace (FISH) s použitím sond pro tandemové repetice, dříve identifikované v genomu plicníku, a ribozomální DNA. Analýza odhalila rozdíly v diploidních počtech chromozomů mezi zástupci skupiny: P. mollis subsp. mollis vykazovala 2n =18, přičemž u jednoho jedince byl zaznamenán lichý počet chromozomů (2n = 19), P. murinii obsahovala 14 chromozomů v diploidním stavu (2n = 14), a P. montana subsp. montana obsahovala 2n = 24. Tandemová repetice PulTR05_70 byla u všech analyzovaných jedinců lokalizována v centromerických oblastech všech chromozomů, což naznačuje její možnou roli ve struktuře centromery. Naproti tomu sonda PulTR04_420 byla detekována pouze u P. murinii, což ukazuje na její specifické rozšíření v rámci skupiny mollis. Díky kolokalizaci dalších mapovaných sond bylo možné sestavit a porovnat karyotypy jednotlivých zástupců a jednoznačně identifikovat některé chromozomy.

Abstract:

This cytogenetic study focuses on the Pulmonaria mollis group, which represents an evolutionarily interesting model due to the variability of genome (chromosome) structure, most probably caused by frequent hybridization and polyploidization events during its evolution. To investigate genome organization, fluorescent in situ hybridization (FISH) was employed using probes specific to tandem repeats, previously identified in Pulmonaria genome, as well as ribosomal DNA sequences. The analysis revealed differences in diploid chromosome numbers among the studied taxa: P. mollis subsp. mollis exhibited 2n = 18, with one individual showing an odd chromosome number (2n = 19), P. murinii had 14 chromosomes in the diploid state (2n = 14), and the largest chromosome number was observed in P. montana subsp. montana (2n = 24). Tandemly organized repeat PulTR05_70 was localized to the centromeric regions of all chromosomes in all analyzed taxa, suggesting its potential role in centromere organization. In contrast, the PulTR04_420 probe was detected only in P. murinii, indicating its specific distribution within the mollis group. Colocalisation of the tandem repeats and rDNA sequences enabled reconstruction and comparison of karyotypes and allowed unambiguous identification of some chromosomes in situ.

Klíčová slova

rod Pulmonaria, molekulární cytogenetika, fluorescentní in situ hybridizace, fluorescentní mikroskopie, karyotyp

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 2. 5. 2025

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: Mgr. Eva Hřibová, Ph.D.

UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Molekulární a buněčná biologie / Molekulární a buněčná biologie