Zpět na vyhledávání

Mgr. Martin Klvaňa, Ph.D.

Doctoral thesis

Structure-dynamics-function relationships of haloalkane dehalogenases

Structure-dynamics-function relationships of haloalkane dehalogenases
Abstract:
Pomocí molekulového dokování, molekulově-dynamických simulací, vizualizace struktury a dynamiky proteinu, a ve světle dostupných experimentálních dat byly v halogenalkandehalogenáze DhaA z Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 navrženy mutace pro zvýšení katalytické účinnosti přeměny jedovaté a nepoddajné xenobiotické sloučeniny, 1,2,3-trichlorpropanu, a vztahy mezi strukturou, dynamikou a funkcí tohoto …more
Abstract:
Using molecular docking calculations, molecular dynamics simulations and visualisation of protein structure and dynamics, and in the light of available experimental data, mutations were designed in haloalkane dehalogenase DhaA from Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 for enhancing the catalytic performance with toxic and recalcitrant xenobiotic compound, 1,2,3-trichloropropane, and structure-dynamics …more
 

Keywords

Protein enzym/enzyme halogenalkandehalogenáza/haloalkane dehalogenase vnořené aktivní místo/buried active site tunel/tunnel uvolnění produktu/product release výměna vody/water exchange molekulově–dynamická simulace/molecular dynamics simulation návrh mutantů/design of mutants CAVER
 
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 2. 12. 2009
Identifier: https://is.muni.cz/th/rv1vo/

Thesis defence

  • Date of defence: 8. 1. 2010
  • Supervisor: doc. RNDr. Miroslav Němec, CSc.
  • Reader: prof. RNDr. Luděk Bláha, Ph.D., Assoc. Prof. Jan Florian, dr. Jiří Vondrášek

Citation record

Cite this text

Full text of thesis

Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:
  • světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta
Složka Reference to the local database directory of the institution

Masaryk University

Faculty of Science

Doctoral programme / field:
Biology (4-years) / Microbiology

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.