Diferenciální genová exprese mezi krátkověkou kastou dělníků a dlouhověkou kastou neotenických králů termita Prorhinotermes simplex

Bc. Miloslav BREJCHA

Diplomová práce

Anotace:

Byl sekvenován transkriptom dělníků a mladých a starých neotenických králů termita Prorhinotermes simplex. Výsledky sekvenace byly podrobeny analýze diferenciální exprese genů za účelem odhalení genů stojících za rozdíly v délce života mezi těmito dvěma kastami. Diferenciálně exprimované geny byly funkčně anotovány a podrobeny analýze obohacení genové sady. Použita byla také analýza vážené genové koexpresní sítě.

Abstract:

Transcriptomes of workers and young and old neotenic kings of the termite Prorhinotermes simplex were sequenced. The sequencing results were subjected to differential gene expression analysis to reveal the genes underlying the differences in lifespans between these two castes. Differentially expressed genes were functionally annotated and subjected to gene enrichment analysis. Weighted gene co-expression network analysis was also used.

Klíčová slova

termit, Isoptera, Prorhinotermes simplex, dlouhověkost, stárnutí, sociální hmyz, eusociální hmyz, kastovní systém, reprodukční dělba práce, RNA sekvenace, RNAseq, transkriptom, diferenciální exprese, WGCNA, obohacení genové sady, funkční anotace, apoptóza, oxidační stres, imunita, proteinová homeostáze, lipidický metabolismus

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 8. 12. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: RNDr. Radmila Čapková Frydrychová, Ph.D.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Experimentální biologie - specializace Molekulární a buněčná biologie a genetika