Haptický model interakce biomolekul

Bc. Jiří Filipovič, Ph.D.

Master's thesis

Haptic model of interaction of biomolecules

Anotácia:

V rámci spolupráce Laboratoře interakcí člověka s počítačem na FI MU, Superpočítačového centra ÚVT MU a Národního centra pro výzkum biomolekul PřF MU vzniká aplikace, jejímž cílem je simulovat interakci dvou molekul a umožnit uživateli pomocí haptického zařízení jednu z těchto molekul přímo ovládat a cítit sílu danou silovými interakcemi mezi molekulami. Obsahem diplomové práce je nalezení, implementace a popis metod, které urychlí běh této aplikace tak, aby bylo na dostupném hardware možno dostatečně precizně simulovat interakce větších molekul a umožnit tak její nasazení na reálné chemické problémy.

Abstract:

An application for haptic driven molecular interaction is being developed in a cooperation with Human Computer Interaction Laboratory FI MU, Supercomputer Centre ÚVT MU and National Centre For Biomolecular Research PřF MU. Content of this Master Thesis is finding, implementation and description of methods, that speed up running time of this application so that it will be able to simulate interaction of larger molecules with available hardware and push the application closer to solving real chemical problems.

Kľúčové slová

molekulový doking, haptika, optimalizace, paralelizace, adaptivní mřížka, interpolace

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 7. 1. 2008

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 12. 2. 2008
• Vedúci: Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.
• Oponent: RNDr. Igor Peterlík, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Informatics

Master programme / odbor:
Applied Informatics / Applied Informatics