Selekce linií pšenice seté obsahujících chromozom 3D s delecí v dizomické konstituci

Bc. Dominik VÍTEK

Master's thesis

Screening of wheat lines for disomic 3D chromosome deletion

Anotácia:

Pšenice setá (Triticum aestivum) je významná zemědělská plodina, která tvoří nezanedbatelnou část světové produkce jídla. Informace o struktuře jejího genomu a funkci genů v něm obsažených nám může poskytnout cenné informace, jenž můžeme využít při šlechtění nových odrůd této rostliny. Jedním z genů, jehož porozumění by mohlo vést k průlomu v oblasti šlechtitelství je "pairing homologues" Ph2, který se nachází na chromozomu 3D a hraje důležitou roli při správném párování homologních chromozomů během meiózy. Cílem této práce byla charakterizace potomstva rostlin obsahujících různé delece na chromozomu 3D v monozomické konstituci a selekce souboru 73 rostlinných linií pšenice seté obsahujících tyto delece v dizomické konstituci využitím metody ddPCR. Tento soubor dále poslouží pracovníkům Ústavu experimentální botaniky a jejich výzkumným partnerům k lokalizaci genu Ph2 na chromozomu 3D. Klonování tohoto genu přispěje k porozumění komplexního genomu pšenice seté.

Abstract:

Common wheat (Triticum aestivum) is an essential agricultural resource that makes up a significant portion of the world food supply. Insight into it's genomic structure and gene functions could provide us with valueable information which can be utilized in breeding of new intresting cultivars of the plant. One such gene located on chromosome 3D is "pairing homologues" Ph2 which, as it's name suggests, plays a critical role in correct pairing of homologous chromosomes. Understanding of this gene's function could lead to a scientific breakthrough in common wheat breeding. The goal of this thesis is to conduct a screening of interspecies hybrid progeny containing different 3D chromosome deletions by using ddPCR method. The outcome of these efforts would be a library of 73 plant lines carrying these deletions in disomic constitution. The staff of the Institute of Experimental Botany CAS and their research partners will make use of the library to narrow down the location of Ph2 gene. Cloning of the gene will contribute to our understanding of the complex genome of common wheat.

Kľúčové slová

pšenice setá, selekce pšeničných linií, deleční linie, 3D chromozom, párování homologů, Ph2, ddPCR, droplet digital PCR

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 2. 5. 2019

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 31. 5. 2019
• Vedúci: Mgr. Jan Bartoš, Ph.D.

Palacký University Olomouc

Faculty of Science

Master programme / odbor:
Biology / Experimental Biology