Dysregulace mikroRNA u Waldenströmovy makroglobulinémie

Bc. Tereza Růžičková

Master's thesis

Dysregulation of microRNA in Waldenström macroglobulinemia

Abstract:

Waldenströmova makroglobulinémie a mnohočetný myelom jsou hematoonkologická onemocnění postihující převážně osoby starší 70 let. Tato dvě onemocnění mohou mít velmi podobné klinické projevy. Pro jejich úspěšnou léčbu je zásadní jejich diferenciální diagnostika. Waldenströmova makroglobulinémie se od mnohočetného myelomu liší typem postižených buněk, u Waldenströmovy makroglobulinémie jsou to lymfoplazmocytární buňky a u mnohočetného myelomu jsou to buňky plazmatické. Zásadním rozdílem mezi těmito onemocněními je mutace genu MYD88, která je přítomna pouze u Waldenströmovy makroglobulinémie. Nekódující molekuly RNA, zejména mikroRNA, by mohly být zapojeny do patogeneze těchto dvou onemocnění, a jejich rozdílná exprese by tak mohla být dobrým odlišovacím biomarkerem. Cílem této diplomové práce bylo najít dysregulaci v expresi mikroRNA v buňkách kostní dřeně pacientů s Waldenströmovou makroglobulinémií a mnohočetným myelomem, a současně analyzovat buňky kostní dřeně pacientů s Waldenströmovou makroglobulinémií pro přítomnost mutace genu MYD88, která byla identifikována u devíti z jedenácti analyzovaných vzorků. Metodou sekvenování nové generace bylo nalezeno osm odlišně exprimovaných mikroRNA. Exprese tří z nich byla následně validována pomocí reverzně transkripční kvantitativní polymerázové řetězové reakce.

Abstract:

Waldenström macroglobulinemia and multiple myeloma are both haemato-oncological diseases affecting mainly people over 70 years of age. These two diseases can have very similar clinical manifestations. Differential diagnosis is therefore crucial for their successful treatment. Waldenström macroglobulinemia differs from multiple myeloma in the type of cells affected, with lymphoplasmacytic cells being affected in Waldenström macroglobulinemia and plasma cells being affected in multiple myeloma. The major difference between these two diseases is the mutation in MYD88 gene, which is only present in Waldenström macroglobulinemia. Non-coding RNA molecules, especially microRNAs, could be involved in the pathogenesis of these two diseases and their different expression could be a good differentiating biomarker. The aim of this thesis was to find dysregulated expression of microRNAs in bone marrow cells of Waldenström macroglobulinemia and multiple myeloma patients and at the same time to analyse bone marrow cells of Waldenström macroglobulinemia patients for presence of MYD88 gene mutation, which was found in nine out of eleven samples. Eight differentially expressed microRNAs were found by next-generation sequencing. The expression of three of these miRNAs was subsequently validated by reverse transcription quantitative polymerase chain reaction.

Keywords

Waldenströmova makroglobulinémie, mnohočetný myelom, monoklonální gamapatie, mikroRNA, sekvenování nové generace, MYD88, CXCR4, LYNX, Waldenström macroglobulinemia, multiple myeloma, monoclonal gammopathy, microRNA, next generation sequencing

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 14. 5. 2023

Thesis defence

• Date of defence: 26. 6. 2023
• Supervisor: doc. RNDr. Sabina Ševčíková, Ph.D.
• Reader: doc. Mgr. Jiří Šána, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Science

Master programme / field:
Bioanalytical Laboratory Diagnostics in Medicine - Medical Genetics and Molecular Diagnostics / Bioanalytical Laboratory Diagnostics in Medicine - Medical Genetics and Molecular Diagnostics