Aplikace molekulárních metod na identifikaci nekrofágních zástupců řádu Diptera, typických pro Jihomoravský kraj

Bc. Tamara Mifková

Diplomová práce

Application of Molecular Methods for Identification of Necrophagous Species of the Diptera Order Typical for South Moravian Region

Anotace:

Nekrofágní hmyz hraje významnou roli především v kriminalistické praxi, a to hlavně při určování doby smrti. Tato práce si kladla za cíl monitorovat zástupce řádu Diptera na vybraných lokalitách Jihomoravského kraje - Sokolnice a Rakvice. Dále byli tito zástupci identifikováni anatomicko-morfologickými a molekulárně-genetickými metodami, které byly mezi sebou porovnány. K tomuto účelu bylo nutné izolovat DNA, amplifikovat úsek genu cytochromoxidázy I (COI) pomocí metody PCR a dalším zpracováním získat sekvence vybraných jedinců z mitochondriálního genomu. Ve výsledcích pokusu se více shodovaly s morfologickou identifikací výstupy databáze BOLD, než výstupy z databáze BLAST. Anatomicko-morfologickým sledováním nelze vždy přesně určit rod a druh nekrofága, je totiž závislé nejen od vývojového stádia hmyzu a jeho stavu, ale i od odborné znalosti determinátora. Proto je vhodnější využít kombinaci anatomicko-morfologických a molekulárně-genetických metod determinace, což potvrzují výsledky této diplomové práce.

Abstract:

Necrophagous insects plays an important role, especially in forensic practice, especially in determining the time of death. This work was aimed to monitor necrophagous species of the Diptera order in selected localities of South Moravian Region - Rakvice and Sokolnice. Furthermore, these necrophagous species were identified with anatomical-morphological and molecular genetic methods, which have been compared to each other. For this purpose it was necessary to isolate a DNA segment and amplify cytochrome oxidase I (COI) gene by the PCR method and with further processing to obtain the sequence of selected individuals from the mitochondrial genome. The results of the experiment more coincided with morphological identification database BOLD outputs than with outputs from the BLAST database. Anatomical and morphological identification cannot always accurately determine the genus and species necrophags, the assesment is not dependent not only on the development stage of the insect and its condition, but also on the expertise of the determinator. Most accurater results are achieved with use the combination of anatomical and morphological and molecular-genetic methods of determination, which is confirmed by the results of this thesis.

Klíčová slova

forenzní entomologie, Diptera, mrtvé tělo, DNA barcoding

Keywords

Diptera, forensic entomology, corpse, DNA barcoding

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 2. 5. 2016

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: doc. Ing. Marie Borkovcová, Ph.D.

Mendelova univerzita v Brně

Agronomická fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Zootechnika / Živočišné biotechnologie