Mapování genů kvantitativních znaků u diploidní pšenice T. monococcumL

Barbora Klocová

Master's thesis

Mapping of quantitative traits in diploid wheat T. monococcumL

Abstract:

Pšenice je jednou z nejdůležitějších plodin světa podílejících se na výživě lidstva. V posledních letech její spotřeba převyšuje produkci a tak je nutné pěstovat výnosnější kultivary. Pšenice setá má relativně velký allohexaploidní genom, což z ní dělá nejkomplexnější kulturní plodinu. Využití diploidních předků pro mapování a studium genomu je jednou z hlavních cest efektivního studia genomu pšenice a identifikaci agronomicky důležitých genů. Pro účely mapování a studium výnosových prvků byla zkonstruována genetická mapa z mapovací populace rekombinatních inbredních linií (RILs) odvozených z křížení Triticum monococcum ssp. monococcum × Triticum monococcum ssp. aegilopoides. Mapa má celkovou délku 829 cM s 628 zamapovanými STS, IRAP, DArT markery pokrývajících všech sedm chromozomů. Což jí řadí mezi nejhustější genetické mapy pšenice. Mapa byla použita k identifikaci QTL lokusů pro celkem sedm znaků, tři znaky pro výnos, tři agronomicky významné znaky a jeden morfologický znak, ve kterých se rodiče významně odlišovali. Znaky pro QTL analýzu byly sledovány jeden rok na dvou lokalitách ve dvou opakováních. Bylo identifikováno celkem 14 QTL lokusů na šesti chromozomech

Abstract:

Wheat is one of the most important crops involved in human nutrition. In recent years, its consumption exceeds production, so it is necessary to breed cultivars with higher yield. Bread wheat is allohexaploid species and has a relatively large genome, which makes it one of the most komplex crops. Use of diploid ancestors for genome mapping and studies is one of the main ways of effective study of the genome of wheat and the identification of agronomically important genes. At present time the most densest genetic map of the wheat A genome was constructed to study genetics of yield components. The map was constructed using 628 STS, IRAP, DART markers and 82 SSD F8 lines derived from the cross of Triticum monococcum ssp monococcum × Triticum monococcum ssp aegilopoides. Total length of the map was 829 cM and linkage groups without gap were identified for all 7 chromosomes. Preliminary QTL analysis for seven yield and morphological traits on this mapping population yielded 14 QTLs on all chromosomes except chromosome 6. The constructed genetic map will be used to precise map yield components and other traits on this mapping population and test their usage in wheat breeding programs

Keywords

pšenice, T. monococcum, kvantitativní znaky, mapování, komponenty výnosu, QTL lokus

Keywords

wheat, T. monococcum, quantitative traits, mapping, yield components, QTL locus

Language used: Czech

Date on which the thesis was submitted / produced: 12. 5. 2010

Thesis defence

• Date of defence: 9. 6. 2010
• Supervisor: Miroslav Valárik
• Reader: Tibor Sedláček

Univerzita Palackého

Přírodovědecká fakulta

Master programme / field:
Biologie / Molekulární a buněčná biologie