Stanovení genospecies rodu Borrelia získaných z různých oblastí České republiky pomocí DNA sekvenace

Bc. Monika Kopečková

Bakalářská práce

Determination of genespecies of the genus Borrelia obtained from various regions of the Czech Republic by DNA sequencing

Anotace:

Tato bakalářská práce pojednává o problematice Lymeské boreliózy. Jedná se o velmi závažné onemocnění způsobované bakterií rodu Borrelia. Hostitelem těchto bakterií jsou především klíšťata rodu Ixodes. V první části práce lze nalézt fakta jak o nemoci, tak o původcích i přenašečích. Cílem práce bylo zjistit pozitivitu klíšťat pomocí qPCR (Real-Time PCR) a následně pozitivní vzorky sekvenovat a zjistit tak zastoupení jednotlivých druhů. Celkem bylo otestováno 733 vzorků klíšťat získaných ze všech krajů České republiky. Bylo zjištěno, že 165 vzorků (22,5 %) tvoří vzorky pozitivní na Bbsl, u 114 vzorků byl zjištěn i konkrétní druh.

Abstract:

This Bachelor thesis is about Lyme disease, which is serious illness caused by complex of bacteria Borrelia burgdorferi. Host of these bacteria is a tick of genus Ixodes. The first part of this thesis talks about the illness, bacteria and hosts. The aim was to test the positivity of the ticks within qPCR (Real-Time PCR). Then we were sequencing the positive samples and found out the species of Borrelia. There were 733 samples together and 165 (22,5 %) of them were positive. In 114 samples we were able to determine the genospecies of Borrelia.

Klíčová slova

Borrelia burgdorferi, Ixodes ricinus, Lymská borelióza, Lyme disease, sekvenování DNA, DNA sequencing

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 16. 5. 2018

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 12. 6. 2018
• Vedoucí: prof. RNDr. Omar Šerý, Ph.D.
• Oponent: doc. Mgr. Monika Vítězová, Ph.D.

Masarykova univerzita

Přírodovědecká fakulta

Bakalářský studijní program / obor:
Biochemie / Biochemie