Prevalence střevního prvoka \kur{Dientamoeba fragilis} v populaci lidí a zvířat v České republice.

Bc. Andrea KAŠPAROVÁ

Diplomová práce

Anotace:

Hlavním cílem této diplomové práce bylo zjistit prevalenci střevního prvoka Dientamoeba fragilis v populaci zdravých lidí a jejich zvířat v České republice pomocí dvou molekulárních přístupů. Celkem bylo analyzováno 296 vzorků stolice od lidí a 135 vzorků od 18 druhů zvířat. Pomocí real-time PCR (qPCR) byla u lidí zjištěna prevalence 24 % a pomocí konvenční PCR (cPCR) 7 %. Kromě toho byla porovnána citlivost těchto dvou metod pro detekci D. fragilis. Na základě našich výsledků jsme zjistili, že qPCR je citlivější metoda než cPCR. U lidí bylo zjištěno několik faktorů ovlivňujících výskyt D. fragilis. Vyšší prevalence D. fragilis byla pozorována u lidí, kteří žijí na vesnici, cestují mimo Evropu a jsou v častém kontaktu s hospodářskými zvířaty. U zvířat byla D. fragilis pomocí qPCR detekována u 11 % vzorků od osmi druhů zvířat. Díky Sangerovu sekvenování jsme zjistili, že u všech lidských pozitivních vzorků se jednalo o Genotyp 1. Navíc byla pozorována ko-infekce D. fragilis a Blastocystis spp. u téměř poloviny kolonizovaných lidí.

Abstract:

The main aim of this study was to find out the prevalence of Dientamoeba fragilis in the gut-healthy humans and their animals using two molecular approaches. A total of 296 stool samples from humans and 135 samples from 18 animal species were analyzed. Using real-time PCR (qPCR), a prevalence of 24% was found in humans in contrast to conventional PCR (cPCR) (7%). In addition, we compared the sensitivity of these two methods for detection of D. fragilis. Based on our results, we found out that qPCR is more sensitive method than cPCR. In humans, several factors were found to influence the occurrence of D. fragilis. A higher prevalence of D. fragilis was observed among people who live in a village, traveling outside Europe and are in frequent contact with farm animals. In animals, D. fragilis was detected in 11% of samples from eight species using qPCR. Thanks to Sanger sequencing, we found that all positive samples from humans only were Genotype 1. In addition, co-infection D. fragilis with Blastocystis spp. was observed in nearly half of the colonized humans.

Klíčová slova

Dientamoeba fragilis, střevní prvok, prevalence, Česká republika, lidští dobrovolníci, zvířata, genotypy, molekulární detekce

Jazyk práce: čeština

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 13. 4. 2023

Obhajoba závěrečné práce

• Vedoucí: MVDr. Kateřina Jirků, Ph.D.

JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH

Přírodovědecká fakulta

Magisterský studijní program / obor:
Biologie / Klinická biologie