Metabolism of benzophenanthridine alkaloids and their interaction with G-quadruplexes

Mgr. Roman Sándor, Ph.D.

Doctoral thesis

Anotácia:

V této práci jsme studovali metabolismus benzofenantridinových alkaloidů (alkaloidy sanguinarin, sanguilutin, sanguirubin, chelerytrin, chelilutin, chelirubin a makarpin) a jejich interakce s nekanonickými strukturami DNA. Enzymatický aparát CYP450 z mikrozomů z potkaních jater byl použit pro produkci metabolitů těchto 7 alkaloidů a ty byly následně detekovány vysokoúčinnou kapalinovou chromatografií spojenou s tandemovou hmotnostní spektrometrií. Dále jsme studovali redukci sanguinarinu pomocí NADH v bez přítomnosti enzymů. Nakonec jsme studovali afinitu vybraných benzofenantridinů a protoberberinů k G-kvadruplexovým strukturám DNA.

Abstract:

In this work, we have studied the metabolism and non-canonical DNA interactions of benzo[c]phenanthridine alkaloids – sanguinarine, sanguilutine, sanguirubine, chelerythrine, chelilutine, chelirubine and macarpine. Rat liver microsomes were used to produce metabolites of the 7 alkaloids by the CYP450 enzymatic apparatus and these were then detected by high-performance liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry. Next, we have studied the reduction of sanguinarine by NADH in the absence of any enzymes. Lastly, selected benzophenanthridines and protoberberines were studied on their affinity to G-quadruplexes.

Keywords

Benzo[c]phenanthridine alkaloids, liquid chromatography, mass-spectrometry, G-quadruplex, cytochrome 450, xenobiotic metabolism

Jazyk práce: English

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 28. 7. 2022

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 8. 11. 2022
• Vedúci: prof. RNDr. Eva Táborská, CSc.
• Oponent: prof. PharmDr. Karel Šmejkal, Ph.D., doc. RNDr. Jitka Vostálová, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Medicine

Doctoral programme / odbor:
Physiology, Pathological Physiology, Medical Chemistry and Biochemistry / Medical Chemistry and Biochemistry