Segmentation of Cell Nuclei in Large-Scale Multichannel Image Data of Organoids – Bc. Jan Juračka
Bc. Jan Juračka
Master's thesis
Segmentation of Cell Nuclei in Large-Scale Multichannel Image Data of Organoids
Segmentation of Cell Nuclei in Large-Scale Multichannel Image Data of Organoids
Abstract:
Segmentace zajímavých objektů, jako jsou buněčná jádra, v mikroskopickém obrazu, náročný úkol. V dnešní době diktují state-of-the-art vlastnosti v této oblasti neuronové sítě. Trénink těchto sítí však vyžaduje nezanedbatelné množství anotovaných dat. Získávání těchto dat je obtížný proces, který není ani vždy možný. Netriviální ztížení zmíněného problému dále plyne z faktu, že mikroskopická data bývají …moreAbstract:
Segmenting objects of interest, such as cell nuclei, inside microscopy images is a challenging task. Convolutional neural networks dictate the state-of-the-art performance in biomedical image segmentation. Training such networks, however, require a non-negligible amount of annotated data. Obtaining such data in microscopy imaging is a difficult process, which might be even sometimes impossible. As …more
Language used: English
Date on which the thesis was submitted / produced: 16. 5. 2023
Identifier:
https://is.muni.cz/th/prbte/
Thesis defence
- Date of defence: 22. 6. 2023
- Supervisor: doc. RNDr. Martin Maška, Ph.D.
- Reader: Mgr. Karel Štěpka, Ph.D.
Citation record
Full text of thesis
Contents of on-line thesis archive
Published in Theses:- světu
Other ways of accessing the text
Institution archiving the thesis and making it accessible: Masarykova univerzita, Fakulta informatikyMasaryk University
Faculty of InformaticsMaster programme / field:
Visual informatics / Image Processing and Analysis
Theses on a related topic
-
Identifikace a kvantifikace kolagenních vláken z mikroskopických obrazů
Jana Putová -
Morfologická analýza a kvantifikace koloniálních pikoplanktonních sinic metodou analýzy obrazu
Jakub PSOHLAVEC -
Analýza buněčné polarizace pomocí pokročilých mikroskopických metod
Štěpán Čada -
Segmentation of Membrane-Stained Cells in Image Data of Organoids
Bruno Petrus -
Segmentace včel na obrázcích plástů
Sergei FILITOV -
Segmentace včel na obrázcích plástů
Sergei FILITOV