Knihovna pro tvorbu pluginů pro PyMOL

Bc. Matěj Škrabánek

Bachelor's thesis

A Tool for Developing PyMOL Plugins

Anotácia:

V dnešní době existuje škála programů zabývající se analýzou makromolekulárních struktur a nové jsou denně vyvíjeny. Cílem této práce je vytvoření nástrojů, které umožní těmto programům přístup k vizualizační aplikaci PyMOL, a to způsobem vytvářejícím jak možnosti překladu výstupních dat analytických programů do dat, které je aplikace PyMOL schopna zobrazit, tak možností tvorby uživatelského rozhraní vlastního programu jako rozšíření aplikace PyMOL. Ve snaze naplnění tohoto cíle byly vytvořeny nástroje v podobě knihovny PyMOLBuilder a aplikace PyMOLPluginCompiler umožnující překlad programů napsaných v jazyce C# do jazyka Python. Tyto nástroje jsou pak vybudovány na teoretickém základu analytické části dnešních kompilátorů a praktickém využití metod projektu Roslyn, možností vytváření rozšíření programů napsaných v jazyce Python a metod návrhu a tvorby rozšiřitelných a snadno použitelných knihoven.

Abstract:

In today's world there exists range of programs dealing with analysis of macromolecular structures and new are being created every day. Goal of this thesis is creation of tools, that will allow these programs to access visualization aplication PyMOL. For this reason library PyMOLBuilder and aplication PyMOLPluginCompiler were created allowing transformation of programs writen in language C# to programs in language Python. These tools are based upon analytic part of modern compilers and practical usage of methods of project Roslyn.

Kľúčové slová

PyMOL, Python, C#, Roslyn, plugin, kompilátor.

Jazyk práce: Czech

Datum vytvoření / odevzdání či podání práce: 21. 5. 2012

Obhajoba závěrečné práce

• Obhajoba proběhla 20. 6. 2012
• Vedúci: RNDr. David Sehnal, Ph.D.
• Oponent: doc. RNDr. Radka Svobodová Vařeková, Ph.D.

Masaryk University

Faculty of Informatics

Bachelor programme / odbor:
Applied Informatics / Applied Informatics